| 1 | アカイ メアリー | 白鵬女高 | 4:11.18 | | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 2 | 久保 凛 | 東大阪大敬愛高校 | 4:11.38 | +0.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 3 | シュブルチェック アンナ | 牛久高校 | 4:19.97 | +8.79 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 4 | 黒田 六花 | 仙台育英 | 4:21.01 | +9.83 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 5 | 村井 和果 | 薫英女学院 | 4:21.65 | +10.47 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 6 | 川上 南海 | 長野東高校 | 4:22.36 | +11.18 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 7 | 尾﨑 一樺 | 智辯カレッジ高 | 4:24.95 | +13.77 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 8 | 藤田 莉沙 | 倉敷高 | 4:25.01 | +13.83 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 9 | 嶋本 はな乃 | 筑紫女学園高 | 4:26.22 | +15.04 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 10 | 松浦 銘玉 | 埼玉栄 | 4:26.67 | +15.49 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
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| 11 | 藤井 柑奈 | 西条農 | 4:26.87 | +15.69 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 12 | 本間 栞 | 山形中央 | 4:27.30 | +16.12 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 稲井 円花 | 共愛学園高校 | 4:27.44 | +16.26 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 14 | 立石 里央菜 | 城東 | 4:28.66 | +17.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 15 | 杉安 一葉 | 熊本ルーテル学院 | 4:29.92 | +18.74 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 16 | 御手洗 心菜 | 今治西 | 4:30.54 | +19.36 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 17 | 宇都宮 桃奈 | 札幌山の手高校 | 4:31.43 | +20.25 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 18 | 伊藤 晴香 | 駒澤大学 | 4:32.80 | +21.62 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 19 | 井上 穂奏 | 東海大相模高校 | 4:33.02 | +21.84 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 井内 櫻子 | 札幌日大高校 | 4:37.81 | +26.63 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 21 | 栗原 未羽 | 共愛学園高校 | 4:39.61 | +28.43 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 22 | 井門 萌 | 聖カタリナ高 | 4:40.07 | +28.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 23 | 金子 心乃 | 旭川龍谷高校 | 4:41.32 | +30.14 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 24 | 田村 爽葉 | 共愛学園高校 | 4:43.23 | +32.05 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 25 | 志田 采世 | 富山商高 | 4:44.93 | +33.75 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 26 | 菅野 美波 | 筑紫女学園高 | 4:52.91 | +41.73 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 27 | 宮本さくら | 諫早 | 4:56.25 | +45.07 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
