| 1 | ジャネット ジェプコエチ | 倉敷高 | 4:08.53 | | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 2 | 芦田 和佳 | 立命館宇治 | 4:14.55 | +6.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 3 | 池野 絵莉 | 須磨学園高校 | 4:16.73 | +8.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 4 | 木田 美緒莉 | 旭川龍谷高校 | 4:19.00 | +10.47 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 5 | 杉森 由萌 | 中央中等高 | 4:20.58 | +12.05 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 6 | 児玉 彩花 | 光ヶ丘女子 | 4:21.02 | +12.49 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 7 | 野口 紗喜音 | 神村学園高校 | 4:22.50 | +13.97 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 8 | 吉田 彩心 | 札幌創成高校 | 4:24.47 | +15.94 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 9 | 中村 愛琉 | 北九州市立高 | 4:24.75 | +16.22 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 10 | ドルーリー 朱瑛里 | 津山 | 4:25.47 | +16.94 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
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| 11 | 前田 二千翔 | 三浦学苑高校 | 4:26.10 | +17.57 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 12 | 狩野 美羽音 | 北九州市立高 | 4:26.36 | +17.83 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 江頭 七海 | 同志社大学 | 4:27.55 | +19.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 14 | 杤尾 佳穂 | 西京高 | 4:28.57 | +20.04 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 15 | 藤重 桃子 | 市立船橋高校 | 4:28.82 | +20.29 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 15 | 蒲生 悠桜 | 豊川 | 4:28.82 | +20.29 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 17 | 大谷 芽以 | 名城大学 | 4:28.91 | +20.38 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 18 | 瀬戸口 凜 | 神村学園 | 4:30.23 | +21.70 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 19 | 有田 彩乃 | 宮崎日大 | 4:30.36 | +21.83 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 小川 真生 | 稲生 | 4:31.05 | +22.52 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 21 | 手塚 蕾 | 仙台育英 | 4:31.13 | +22.60 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 22 | 越智 愛奈 | 今治北高 | 4:31.57 | +23.04 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 23 | 宇野 莉里杏 | 中京大中京 | 4:32.41 | +23.88 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 24 | 篠田 心晴 | 筑波大学 | 4:32.51 | +23.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 25 | 長谷川 采花 | 札幌山の手高校 | 4:33.20 | +24.67 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 26 | 石川 桃子 | 新潟明訓 | 4:33.65 | +25.12 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 27 | 辻本 ひまり | 星稜 | 4:33.85 | +25.32 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 28 | 福田 せりえ | 新潟明訓高校 | 4:33.99 | +25.46 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 29 | 若林 藍那 | 亜細亜大学 | 4:35.08 | +26.55 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 30 | 前田 百花 | 駿河台大学 | 4:39.63 | +31.10 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 31 | 吉原 碧彩 | 千原台高 | 4:40.42 | +31.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 32 | 青木 美空 | 大阪学院大学 | 4:42.51 | +33.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
