| 1 | 西村 悠也高2 | 水口東高 | 4:11.20 | | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 2 | 福永 怜央高2 | 長浜北高 | 4:13.34 | +2.14 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 3 | 畑 仁智甫高2 | 膳所高 | 4:14.00 | +2.80 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 4 | 水野 遥翔高2 | 甲西高 | 4:17.68 | +6.48 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 5 | 福本 瑛士高2 | 彦根東高 | 4:20.30 | +9.10 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 6 | 夜野 統真高1 | 大津商高 | 4:20.46 | +9.26 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 7 | 石原 聡太高2 | 守山高 | 4:27.06 | +15.86 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 8 | 牛谷 和士高2 | 虎姫高 | 4:27.31 | +16.11 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 9 | 荒木 睦桔高2 | 水口東高 | 4:27.85 | +16.65 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 10 | 今村 蒼空高2 | 甲西高 | 4:28.36 | +17.16 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
|
| 11 | 横山 玲央高1 | 彦根翔西館高 | 4:28.90 | +17.70 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 12 | 大﨑 真之介高2 | 立命館守山高 | 4:29.50 | +18.30 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 12 | 辻 詩雅高2 | 八日市高 | 4:29.50 | +18.30 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 14 | 前田 大和高2 | 草津高 | 4:30.24 | +19.04 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 15 | 各務 瑛太高2 | 彦根東高 | 4:31.59 | +20.39 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 16 | 大森 晴登高2 | 水口東高 | 4:32.79 | +21.59 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 17 | 奥田 凛太郎高2 | 水口東高 | 4:33.28 | +22.08 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 18 | 奥田 涼太郎高2 | 八日市高 | 4:33.33 | +22.13 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 19 | 高砂 大和高2 | 光泉カトリック高 | 4:33.88 | +22.68 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 20 | 葛川 宗佑高2 | 長浜北高 | 4:35.37 | +24.17 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 21 | 前川 莉澄高1 | 虎姫高 | 4:36.48 | +25.28 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 22 | 吉田 治且高1 | 彦根東高 | 4:37.09 | +25.89 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 23 | 北村 愛介高1 | 日野高 | 4:37.59 | +26.39 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 24 | 木野 羽琉高2 | 彦根東高 | 4:37.74 | +26.54 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 25 | 西田 泰輔高2 | 守山高 | 4:37.92 | +26.72 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 26 | 西嶋 龍世高2 | 長浜北高 | 4:39.47 | +28.27 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 27 | 田代 恵土高2 | 大津商高 | 4:39.69 | +28.49 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 28 | 杉村 優介高1 | 八幡高 | 4:39.92 | +28.72 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 29 | 中川 雄心高2 | 彦根東高 | 4:39.94 | +28.74 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 30 | 山岡 勇登高1 | 膳所高 | 4:41.17 | +29.97 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 31 | 大山 椋平高1 | 高島高 | 4:41.33 | +30.13 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 32 | 松岡 奏空高2 | 甲西高 | 4:43.17 | +31.97 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 33 | 髙倉 暖磨高2 | 八日市高 | 4:44.29 | +33.09 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 34 | 青山 松史高1 | 草津高 | 4:45.40 | +34.20 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 35 | 西堀 昇之介高1 | 八日市高 | 4:46.40 | +35.20 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 36 | 生駒 了雅高2 | 長浜北星高 | 4:47.12 | +35.92 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 37 | 岡田 圭祐高1 | 石山高 | 4:47.92 | +36.72 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 38 | 白井 澄人高1 | 八幡高 | 4:48.36 | +37.16 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 39 | 山本 朝陽高1 | 八日市高 | 4:48.50 | +37.30 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 40 | 福山 隼矢高1 | 日野高 | 4:49.16 | +37.96 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 41 | 小葉 海人高1 | 近江高 | 4:50.05 | +38.85 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 42 | 堀内 朝斗高2 | 守山高 | 4:53.04 | +41.84 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 43 | 小林 琉生高1 | 八日市高 | 4:53.53 | +42.33 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 44 | 中村 浩太高2 | 瀬田工高 | 4:58.10 | +46.90 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 45 | 神村 岳高1 | 彦根東高 | 4:59.40 | +48.20 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 46 | 中村 俐玖高2 | 八幡商高 | 5:02.54 | +51.34 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 47 | 角 壱茶高1 | 八幡工高 | 5:06.24 | +55.04 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 48 | 小林 拓斗高1 | 水口東高 | 5:15.10 | +1:03.90 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 49 | 澁谷 峻高2 | 彦根東高 | 5:18.04 | +1:06.84 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 50 | 永福 大聖高2 | 彦根東高 | 5:19.62 | +1:08.42 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 51 | 三嶋 奏汰高1 | 河瀬高 | 5:20.38 | +1:09.18 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 52 | 清岡 悠輝高1 | 幸福関西高 | 5:21.11 | +1:09.91 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 53 | 下村 駿高1 | 彦根東高 | 5:32.95 | +1:21.75 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 54 | 松宮 大也高2 | 八幡商高 | 5:36.19 | +1:24.99 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 55 | 北川 稜馬高1 | 八幡商高 | 5:44.45 | +1:33.25 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |