| 1 | 矢野 侑典 | 宮崎小林 | 3:53.47 | | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 2 | 豊里 祐至 | 佐土原 | 4:09.80 | +16.33 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 3 | 山本 紘大 | 宮崎商業 | 4:12.49 | +19.02 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 4 | 圖師 寛太 | 宮崎西 | 4:12.57 | +19.10 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 5 | 清水 蒼斗 | 都城高専 | 4:13.29 | +19.82 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 6 | 河野 有馬 | 宮崎北 | 4:13.88 | +20.41 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 7 | 宮﨑 俊輔 | 宮崎北 | 4:20.91 | +27.44 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 8 | 田中 遥登 | 尽誠学園高 | 4:23.33 | +29.86 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 9 | 山下 勇星 | 延岡商業 | 4:24.25 | +30.78 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 10 | 光岡 蒼眞 | 延岡 | 4:25.83 | +32.36 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
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| 11 | 寿崎 舜 | 延岡商業 | 4:28.62 | +35.15 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 12 | 福重 瑛太 | 都城泉ヶ丘 | 4:30.85 | +37.38 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 13 | 工藤 凛久 | 延岡工業 | 4:33.57 | +40.10 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 14 | 山口 詩恩 | 延岡星雲 | 4:34.53 | +41.06 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 15 | 鮫島 陽加 | 妻 | 4:37.61 | +44.14 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 16 | 橋田 結歩 | 宮崎南 | 4:39.84 | +46.37 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 17 | 津田 直樹 | 宮崎西 | 4:40.04 | +46.57 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 18 | 小中原緩哉 | 都城 | 4:50.39 | +56.92 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 19 | 舟場 蓮 | 高鍋農業 | 4:58.88 | +1:05.41 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 20 | 菊地 大貴 | 都城きりしま | 5:01.81 | +1:08.34 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 21 | 田中 陽己 | 門川 | 5:06.83 | +1:13.36 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 22 | 後藤 大澄 | 門川 | 5:15.55 | +1:22.08 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 23 | 岩切 翔瑚 | 宮崎第一 | 5:28.95 | +1:35.48 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 24 | 田崎 瑛 | 都城きりしま | 5:37.75 | +1:44.28 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 25 | 井戸川侑督 | 日南振徳 | 5:39.74 | +1:46.27 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 26 | 福井 直希 | 都城きりしま | 6:39.43 | +2:45.96 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
