| 1 | 長瀨 快 | 東輝 | 4:04.88 | | 全日本中学通信陸上競技大会京都府大会兼全国突破指定大会兼国スポ選考会 |
| 2 | 古塚 斗望 | 亀岡 | 4:05.50 | +0.62 | 京都府中学校総合体育大会陸上競技の部兼全国突破指定大会兼国スポ選考会 |
| 3 | 坂根 樹輝 | 橋立中学校 | 4:06.59 | +1.71 | 全日本中学通信陸上競技大会京都府大会兼全国突破指定大会兼国スポ選考会 |
| 4 | 高橋 来斗 | 日新 | 4:07.79 | +2.91 | 京都府中学校総合体育大会陸上競技の部兼全国突破指定大会兼国スポ選考会 |
| 5 | 永安 逞 | 男山東 | 4:08.35 | +3.47 | 京都府中学校総合体育大会陸上競技の部兼全国突破指定大会兼国スポ選考会 |
| 6 | 水口 陽 | 大宮 | 4:12.32 | +7.44 | 全日本中学通信陸上競技大会京都府大会兼全国突破指定大会兼国スポ選考会 |
| 7 | 志賀 陽梢 | 修学院 | 4:13.06 | +8.18 | 令和8年度第2回京都府中学生記録会 |
| 8 | 古塚 斗望 | 亀岡中 | 4:16.79 | +11.91 | 口丹波中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 9 | 絹笠 楓都 | 京都文教 | 4:17.13 | +12.25 | 京都市中学校総合体育大会陸上競技の部 |
| 10 | 森田 玲音 | 高野 | 4:17.15 | +12.27 | 京都市中学校総合体育大会陸上競技の部 |
|
| 11 | 永井 雄大 | 附属京都 | 4:17.59 | +12.71 | 京都市中学校総合体育大会陸上競技の部 |
| 12 | 小笠 湊十 | 精華西 | 4:17.90 | +13.02 | 第79回山城地方中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 13 | 俣木 遥翔 | 男山東 | 4:19.17 | +14.29 | 令和8年度第2回京都府中学生記録会 |
| 14 | 地迫 楓真 | 寺戸 | 4:21.00 | +16.12 | 第79回山城地方中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 15 | 五井 佑亮 | 東山 | 4:21.02 | +16.14 | 京都市中学校総合体育大会陸上競技の部 |
| 16 | 飯田 圭祐 | 長岡中学校 | 4:21.57 | +16.69 | 第79回山城地方中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 17 | 林 正城 | 泉川 | 4:21.58 | +16.70 | 第79回山城地方中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 18 | 杉本 侑飛 | 京都御池 | 4:24.30 | +19.42 | 京都市中学校総合体育大会陸上競技の部 |
| 19 | 岡本 湊士 | 山科 | 4:24.94 | +20.06 | 京都市中学校総合体育大会陸上競技の部 |
| 20 | 林 涼太 | 男山第三 | 4:26.23 | +21.35 | 第79回山城地方中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 21 | 東野 匠馬 | 若浦 | 4:28.25 | +23.37 | 第７６回 中丹中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 22 | 小山 日向 | 南陵 | 4:29.16 | +24.28 | 第７６回 中丹中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 23 | 野村 煌大 | 精華 | 4:29.51 | +24.63 | 令和８年度 相楽地方中学校陸上競技大会 |
| 24 | 河原林 俊成 | 東輝中 | 4:31.96 | +27.08 | 口丹波中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 25 | 林 涼太 | 男山三 | 4:32.15 | +27.27 | 第78回 綴喜地方中学校夏季体育大会 陸上競技の部 |
| 26 | 森井 颯真 | 梅津 | 4:32.29 | +27.41 | 令和8年度京都市中学校春季総合体育大会陸上競技の部 |
| 27 | 若林 寛通 | 広野 | 4:32.38 | +27.50 | 第42回宇治市中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 28 | 佐藤 那音 | 松原 | 4:32.86 | +27.98 | 令和8年度京都市中学校春季総合体育大会陸上競技の部 |
| 29 | 小畑 大和 | 城南 | 4:34.04 | +29.16 | 第７６回 中丹中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 30 | 佐藤 大惺 | 木津 | 4:34.25 | +29.37 | 令和８年度 相楽地方中学校陸上競技大会 |
| 31 | 甲木 陽琉 | 長岡三 | 4:34.40 | +29.52 | 第54回乙訓地方中学校体育大会 陸上競技の部 |
| 32 | 蘆田 陽介 | 亀岡中 | 4:34.58 | +29.70 | 口丹波中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 33 | 山岡 瞭斗 | 日新 | 4:34.70 | +29.82 | 第７６回 中丹中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 34 | 山岡 慶 | 南陵 | 4:41.14 | +36.26 | 第７６回 中丹中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 35 | 宮木 雄大 | 大住 | 4:47.41 | +42.53 | 第78回 綴喜地方中学校夏季体育大会 陸上競技の部 |
| 36 | 大西 隆輝 | 山城 | 4:47.76 | +42.88 | 令和８年度 相楽地方中学校陸上競技大会 |
| 37 | 山田 蒼 | 東宇治 | 4:49.91 | +45.03 | 第42回宇治市中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 38 | 秋山 遼大 | 木津第二 | 4:51.59 | +46.71 | 令和８年度 相楽地方中学校陸上競技大会 |
| 39 | 猪田 陽生 | 蒲生野中 | 4:57.04 | +52.16 | 口丹波中学校総合体育大会 陸上競技の部 |
| 40 | 北村 旬 | 久御山 | 4:57.41 | +52.53 | 第42回城陽久御山中学校夏季総合体育大会(陸上競技の部) |
| 41 | 岸 悠親 | 木幡 | 4:59.93 | +55.05 | 第42回宇治市中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 42 | 安東 想一郎 | 北宇治 | 5:03.84 | +58.96 | 第42回宇治市中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 43 | 中川 健吾 | 北宇治 | 5:05.47 | +1:00.59 | 第42回宇治市中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
| 44 | 晩田 柊也 | 男山 | 5:11.43 | +1:06.55 | 第78回 綴喜地方中学校夏季体育大会 陸上競技の部 |
| 45 | 高橋 優真 | 南宇治 | 5:12.39 | +1:07.51 | 第42回宇治市中学校夏季総合体育大会 陸上競技の部 |
