| 1 | ジャネット ジェプコエチ | 倉敷高 | 8:48.23 | | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 2 | 芦田 和佳 | 立命館宇治 | 8:59.45 | +11.22 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 3 | 池野 絵莉 | 須磨学園高校 | 9:04.38 | +16.15 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 4 | 吉田 彩心 | 札幌創成高校 | 9:09.26 | +21.03 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 5 | 瀬戸口 凜 | 神村学園 | 9:14.77 | +26.54 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 6 | 南條 愛歩 | 倉敷高 | 9:15.37 | +27.14 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 7 | 前田 二千翔 | 三浦学苑高校 | 9:24.18 | +35.95 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 8 | 杉森 由萌 | 中央中等高 | 9:25.11 | +36.88 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 9 | 松本 瑠莉 | 宇都宮文星女高校 | 9:26.36 | +38.13 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 10 | 佐々木 玲奈 | 筑紫女学園高 | 9:26.66 | +38.43 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
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| 11 | 田畑 陽菜 | 長野東高校 | 9:26.71 | +38.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 12 | 菅原 心菜 | 小林 | 9:27.05 | +38.82 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 杤尾 佳穂 | 西京高 | 9:27.78 | +39.55 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 14 | 福山 若奈 | 埼玉栄高校 | 9:31.22 | +42.99 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 15 | 松本 紗直 | 旭丘 | 9:31.36 | +43.13 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 16 | 石川 桃子 | 新潟明訓 | 9:31.44 | +43.21 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 17 | 湯田 和未 | 学法石川高校 | 9:32.83 | +44.60 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 18 | 谷 凪紗 | 豊川 | 9:34.63 | +46.40 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 19 | 大谷 芽以 | 名城大学 | 9:34.69 | +46.46 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 岡﨑 萌々 | 中大附属横浜高校 | 9:35.43 | +47.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 21 | 長谷川 采花 | 札幌山の手高校 | 9:37.19 | +48.96 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 22 | 大熊 さわ | 福岡大学 | 9:37.43 | +49.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 23 | 吉原 碧彩 | 千原台高 | 9:45.12 | +56.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 24 | 上島 円羅 | 鯖江高校 | 9:45.97 | +57.74 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 25 | 渡辺 光桃 | 仙台育英高校 | 9:47.00 | +58.77 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 26 | 合田 安伽梨 | 旭川龍谷高校 | 9:47.71 | +59.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 27 | 越智 愛奈 | 今治北高 | 9:48.40 | +1:00.17 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 28 | 中島 絢音 | 鹿児島鹿児島高 | 9:52.57 | +1:04.34 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 29 | 杉浦 華夏 | 岡崎城西 | 10:00.55 | +1:12.32 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 30 | 峯下 優華 | 城ノ内中等高 | 10:10.21 | +1:21.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 31 | 小林 桜來 | 北海道栄高校 | 10:12.25 | +1:24.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 32 | 松原 こころ | 旭川龍谷高校 | 10:14.85 | +1:26.62 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
