| 1 | 山内 大矢高2 | 杵築高 | 8:42.45 | | 2026年度 第1回春季陸上競技大会 |
| 2 | 安部 晃洋高1 | 大分東明高校 | 8:59.88 | +17.43 | 県高校総体オープンの部 |
| 3 | 園田 虎太朗高1 | 大分東明高校 | 9:02.86 | +20.41 | 県高校総体オープンの部 |
| 4 | 古本 瞭太高1 | 大分東明高校 | 9:05.04 | +22.59 | 県高校総体オープンの部 |
| 5 | 少路 悠人高3 | 大分東明高校 | 9:05.07 | +22.62 | 県高校総体オープンの部 |
| 6 | 山下 寛人高1 | 藤蔭高 | 9:07.53 | +25.08 | 県高校総体オープンの部 |
| 7 | 市川 大貴高3 | 別府鶴見丘高 | 9:08.61 | +26.16 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 8 | 中山田 蒼汰高3 | 大分東明高校 | 9:09.55 | +27.10 | 県高校総体オープンの部 |
| 9 | 平山 仁翔高1 | 杵築高 | 9:10.56 | +28.11 | 県高校総体オープンの部 |
| 10 | 辛島 兼護高1 | 藤蔭高 | 9:11.99 | +29.54 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
|
| 11 | 谷村 凌祐高1 | 大分東明高校 | 9:13.70 | +31.25 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 12 | 久知良 勇翔高2 | 大分東明高校 | 9:14.09 | +31.64 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 13 | 中野 颯大高2 | 藤蔭高 | 9:16.63 | +34.18 | 県高校総体オープンの部 |
| 14 | 岩下 帝雅高1 | 大分東明高校 | 9:19.61 | +37.16 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 15 | 清田 航羽高2 | 大分東明高校 | 9:21.94 | +39.49 | 県高校総体オープンの部 |
| 16 | 森 健大朗高3 | 藤蔭高 | 9:24.78 | +42.33 | 県高校総体オープンの部 |
| 17 | 河邉 祐斗高1 | 藤蔭高 | 9:25.36 | +42.91 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 18 | 佐藤 丈太郎高1 | 大分東明高校 | 9:26.91 | +44.46 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 19 | 袖 瑞希高2 | 大分東明高校 | 9:29.84 | +47.39 | 県高校総体オープンの部 |
| 20 | 大石 颯汰高2 | 鶴崎工高 | 9:31.53 | +49.08 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 21 | 江藤 優樹高2 | 藤蔭高 | 9:31.99 | +49.54 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 22 | 川島 藍司高1 | 藤蔭高 | 9:32.19 | +49.74 | 県高校総体オープンの部 |
| 23 | 髙根澤 清真高1 | 大分舞鶴高 | 9:33.11 | +50.66 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 24 | 平野 翔真高2 | 大分東明高校 | 9:34.06 | +51.61 | 県高校総体オープンの部 |
| 25 | 前原 拓実高1 | 藤蔭高 | 9:39.31 | +56.86 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 26 | 本川 大喜高1 | 藤蔭高 | 9:39.32 | +56.87 | 県高校総体オープンの部 |
| 27 | 田吹 怜翔高1 | 藤蔭高 | 9:39.88 | +57.43 | 県高校総体オープンの部 |
| 28 | 佐伯 駿人高1 | 大分東明高校 | 9:39.92 | +57.47 | 県高校総体オープンの部 |
| 29 | 河野 宅摩高3 | 高田高 | 9:43.97 | +1:01.52 | 2026年度 第1回春季陸上競技大会 |
| 30 | 小池 陸翔高1 | 藤蔭高 | 9:47.96 | +1:05.51 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 31 | 祖父江 幸志高1 | 大分舞鶴高 | 9:58.01 | +1:15.56 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 32 | 白根 拓馬高2 | 大分舞鶴高 | 9:58.45 | +1:16.00 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 33 | 古賀 孟高3 | 藤蔭高 | 10:00.94 | +1:18.49 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 34 | 山本 蒼介高2 | 大分雄城台高 | 10:07.36 | +1:24.91 | 2026年度 第1回春季陸上競技大会 |
| 35 | 鶴田 大雅高1 | 杵築高 | 10:07.87 | +1:25.42 | 県高校総体オープンの部 |
| 36 | 永田 瑠衣高1 | 柳ケ浦高 | 10:12.60 | +1:30.15 | 県高校総体オープンの部 |
| 37 | 甲斐 一真高2 | 大分上野丘高 | 10:20.20 | +1:37.75 | 県高校総体オープンの部 |
| 38 | 井野上 流星高3 | 三重総合高 | 10:26.46 | +1:44.01 | 県高校総体オープンの部 |
| 39 | 藤井 碧波高2 | 別府鶴見丘高 | 10:27.35 | +1:44.90 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 40 | 佐藤 叶琉高2 | 別府鶴見丘高 | 10:29.43 | +1:46.98 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 41 | 後藤 優人高3 | 大分舞鶴高 | 10:30.19 | +1:47.74 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 42 | 井澤 佑太高1 | 柳ケ浦高 | 10:32.28 | +1:49.83 | 県高校総体オープンの部 |