| 1 | 阿南 晴太郎 | 豊後大野・三重中 | 9:14.85 | | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 2 | 阿曽生 真広 | サザンカRC | 9:15.55 | +0.70 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 3 | 利光 凛人 | 大分・稙田中 | 9:17.78 | +2.93 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 4 | 山田 彪雅 | 大分・大在中 | 9:33.27 | +18.42 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 5 | 園田 悠登 | 大分・稙田中 | 9:36.31 | +21.46 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 6 | 岩﨑 暁音 | 杵築・杵築中 | 9:37.39 | +22.54 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 7 | 水流 晴登 | 豊後高田・高田中 | 9:37.99 | +23.14 | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
| 8 | 後藤 祝仁 | 臼杵・東中 | 9:46.10 | +31.25 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 9 | 吉田 湊 | 臼杵・北中 | 9:49.07 | +34.22 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 10 | 溝邉 晋作 | 由布・挾間中 | 9:57.84 | +42.99 | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
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| 11 | 伊東 直哉 | 大分・大在中 | 9:58.50 | +43.65 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 12 | 小森 遥斗 | 宇佐・安心院中 | 10:01.19 | +46.34 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 13 | 村上 諒太朗 | 大分・稙田中 | 10:01.92 | +47.07 | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
| 14 | 麻生 旺助 | TAKETA T&F | 10:10.26 | +55.41 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 15 | 眞部 隼 | 臼杵・東中 | 10:38.68 | +1:23.83 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 16 | 渡邊 大和 | TAKETA T&F | 10:39.32 | +1:24.47 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 17 | 木籔 瑛斗 | 大分・稙田中 | 10:45.23 | +1:30.38 | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
| 18 | 塩月 悠叶 | 佐伯・佐伯南中 | 10:47.97 | +1:33.12 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 19 | 粟津 遥翔 | 臼杵・東中 | 10:49.34 | +1:34.49 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 20 | 小畑 龍太郎 | 臼杵・西中 | 10:53.06 | +1:38.21 | 大分県中学校合同トライアル練習会 |
| 21 | 山本 昇汰 | 大分・大東中 | 10:54.07 | +1:39.22 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大分大会 |
| 22 | 冨山 陽斗 | 大分・滝尾中 | 10:59.14 | +1:44.29 | 大分県中学校合同トライアル練習会 |
| 23 | 武島 奏尊 | 大分・大在中 | 11:20.06 | +2:05.21 | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
| 24 | 木村 優介 | 玖珠・緑陽中 | 11:28.10 | +2:13.25 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 25 | 水江 翔斗 | 宇佐・西部中 | 11:58.20 | +2:43.35 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 26 | 鶴田 礼旺 | 国東・志成学園 | 12:05.47 | +2:50.62 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |
| 27 | 菊田 璃來 | 宇佐・長洲中 | 12:11.55 | +2:56.70 | 令和８年度第64回大分県中学校総合体育大会【陸上競技】 |