| 1 | 米田 倫都 | 双葉中 | 9:02.75 | | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 2 | 米田 廉都 | 双葉中 | 9:05.92 | +3.17 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 3 | 川島 颯斗 | 彦根西中 | 9:16.43 | +13.68 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 4 | 本山 太智 | 唐崎中 | 9:21.04 | +18.29 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 5 | 澤 唯仁 | 水口中 | 9:24.40 | +21.65 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 6 | 佐藤 悠晴 | 打出中 | 9:34.02 | +31.27 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 7 | 松平 環人 | 八幡中 | 9:36.89 | +34.14 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 8 | 松尾 優生 | 彦根東中 | 9:37.93 | +35.18 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 9 | 境 蒼空 | 新堂中 | 9:39.06 | +36.31 | 第79回夏季総合体育大会 |
| 10 | 林 悠平 | 明富中 | 9:40.62 | +37.87 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
|
| 11 | 吉原 遼 | 高月中 | 9:43.59 | +40.84 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 12 | 高木 春毅 | 志賀中 | 9:44.68 | +41.93 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 13 | 髙山 湊音 | 長浜西中 | 9:44.89 | +42.14 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 14 | 佐久間 智哉 | 野洲北中 | 9:45.28 | +42.53 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 15 | 小倉 優人 | 長浜北中 | 9:50.43 | +47.68 | 第63回春季体育大会 |
| 16 | 大﨑 寛太 | 朝桜中 | 9:51.45 | +48.70 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 17 | 北村 一樹 | 青山中 | 9:52.72 | +49.97 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 18 | 小林 直生 | 聖徳中 | 9:52.76 | +50.01 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 19 | 織田 昇真 | 瀬田北中 | 9:56.35 | +53.60 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 20 | 居原田 煌生 | 野洲北中 | 10:00.78 | +58.03 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 21 | 西岡 蒼介 | 甲西中 | 10:05.47 | +1:02.72 | 第72回全日本中学校通信陸上競技大会滋賀大会 |
| 22 | 杉生 響 | 仰木中 | 10:08.14 | +1:05.39 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 23 | 安藤 健 | 双葉中 | 10:11.42 | +1:08.67 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 24 | 野間 璃碧 | 北大路中 | 10:12.22 | +1:09.47 | 第63回春季体育大会 |
| 25 | 鳥本 竜佑 | 水口中 | 10:15.63 | +1:12.88 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 26 | 岡本 新 | 真野中 | 10:18.83 | +1:16.08 | 第63回春季体育大会 |
| 27 | 上田 瑛仁 | 栗東中 | 10:19.16 | +1:16.41 | 第63回春季体育大会 |
| 28 | 伊藤 颯佑 | 南郷中 | 10:23.16 | +1:20.41 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 29 | 竹内 瑛仁 | 打出中 | 10:26.69 | +1:23.94 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 30 | 万木 草佑 | 志賀中 | 10:29.98 | +1:27.22 | 第63回春季体育大会 |
| 31 | 田中 漣 | 県立守山中 | 10:33.28 | +1:30.53 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 32 | 峠 成粋 | 甲南中 | 10:38.24 | +1:35.49 | 第63回春季体育大会 |
| 33 | 西村 陸 | 彦根中央中 | 10:40.10 | +1:37.35 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 34 | 大西 遥音 | 彦根中央中 | 10:40.71 | +1:37.96 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 35 | 井原 輔 | 甲賀中 | 10:44.71 | +1:41.96 | 第63回春季体育大会 |
| 36 | 難波 大智 | 高穂中 | 10:44.97 | +1:42.22 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 37 | 吉田 颯優 | 南郷中 | 10:45.53 | +1:42.78 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 38 | 北川 龍馬 | 彦根中央中 | 10:45.68 | +1:42.93 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 39 | 柏倉 颯介 | 瀬田北中 | 10:52.79 | +1:50.04 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 40 | 吉田 遥陽 | 河南中 | 10:53.39 | +1:50.64 | 第63回春季体育大会 |
| 41 | 神馬 大地 | 県立守山中 | 10:53.62 | +1:50.87 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 42 | 田辺 光基 | 河瀬中 | 10:55.19 | +1:52.44 | 第63回春季体育大会 |
| 43 | 小島 世成 | 高穂中 | 10:56.65 | +1:53.90 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 44 | 田中 啓志 | 老上中 | 10:58.49 | +1:55.74 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 45 | 岩村 武尊 | 朝桜中 | 10:58.76 | +1:56.01 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 46 | 田中 彰馬 | 朝桜中 | 11:01.92 | +1:59.17 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 47 | 竹下 聡一 | 葉山中 | 11:13.83 | +2:11.08 | 第63回春季体育大会 |
| 48 | 中島 煌太 | 聖徳中 | 11:14.03 | +2:11.28 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 49 | 渡邉 睦樹 | 土山中 | 11:14.97 | +2:12.22 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 50 | 桒原 琢磨 | 湖西中 | 11:15.28 | +2:12.53 | 第63回春季体育大会 |
| 51 | 堀 匡吾 | 長浜北中 | 11:16.86 | +2:14.11 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 52 | 佐々木 陽 | 青山中 | 11:26.28 | +2:23.53 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 53 | 森岡 敦也 | 能登川中 | 11:26.46 | +2:23.71 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 54 | 川本 健聖 | 瀬田中 | 11:28.22 | +2:25.47 | 第63回春季体育大会 |
| 55 | 木村 悠資 | 湖北中 | 11:29.05 | +2:26.30 | 第63回春季体育大会 |
| 56 | 今井 優太 | 老上中 | 11:32.24 | +2:29.49 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 57 | 片岡 有志 | 能登川中 | 11:56.04 | +2:53.28 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 58 | 景山 悠斗 | 中主中 | 11:56.65 | +2:53.90 | 第1回陸協記録会中学の部 |
| 59 | 小玉 啓人 | 葉山中 | 11:58.29 | +2:55.54 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
| 60 | 髙屋 悠人 | 高穂中 | 12:02.28 | +2:59.53 | 第４回Castle Carnival in HIKONE |
