| 1 | 米永 侑悟 | 鹿児島工業高 | 13:55.73 | | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 2 | 藤井 雄大 | 宮崎宮崎日大 | 14:18.25 | +22.52 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 3 | 赤﨑 海太 | 宮崎小林 | 14:25.05 | +29.32 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 4 | 高橋講一郎 | 札幌山の手高校 | 14:34.88 | +39.15 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 5 | 塩見 昊瑛 | 長崎商業高 | 14:36.73 | +41.00 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 6 | 上田 充琉 | 宮崎小林 | 14:37.97 | +42.24 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 7 | 久保 和寛 | 熊本九州学院 | 14:38.85 | +43.12 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 8 | 永本 湊士 | 九州学院高校 | 14:39.47 | +43.74 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 9 | 田中 允紳 | 熊本九州学院 | 14:42.93 | +47.20 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 10 | 本門 望来 | 鹿児島工業高 | 14:45.49 | +49.76 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
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| 11 | 出口 幸汰 | 宮崎宮崎日大 | 14:46.22 | +50.49 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 12 | 渕上 颯大 | 九州学院高校 | 14:46.58 | +50.85 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 13 | 後藤 煌稀 | 熊本工業高 | 14:50.22 | +54.49 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 14 | 近藤 優羽 | 九州学院高校 | 14:56.73 | +1:01.00 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 15 | 高倉 瑛翔 | 宮崎宮崎日大 | 15:00.20 | +1:04.47 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 16 | 原田 惇輝 | 鹿児島鹿児島商高 | 15:03.77 | +1:08.04 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 17 | 福田 幸誠 | 小林高校 | 15:05.56 | +1:09.83 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 18 | 山﨑 侑樹 | 九州学院高校 | 15:09.50 | +1:13.77 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 19 | 大石 隼輔 | 福岡第一高 | 15:09.62 | +1:13.89 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 20 | 尾方 瑛基 | 人吉高 | 15:11.48 | +1:15.75 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 21 | 薮田 舷希 | 九州学院高校 | 15:22.11 | +1:26.38 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 22 | 首藤 成央 | 大分東明高校 | 15:27.83 | +1:32.10 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 23 | 斉藤 元 | 宮崎小林 | 15:43.68 | +1:47.95 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 24 | 島田 寛大 | 熊本国府高 | 15:44.46 | +1:48.73 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 25 | 中村 天茶 | 鹿児島城西高校 | 15:45.45 | +1:49.72 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 26 | 圖師 寛太 | 宮崎西 | 15:48.89 | +1:53.16 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 27 | 山本 紘大 | 宮崎商業 | 16:00.38 | +2:04.65 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 28 | 福留 和真 | 鹿児島高 | 16:07.30 | +2:11.57 | 第37回ゴールデンゲームズinのべおか |
| 29 | 林田 空 | 飯野 | 16:44.90 | +2:49.17 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 30 | 甲斐 蓮也 | 宮崎北 | 16:50.33 | +2:54.60 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 31 | 福重 瑛太 | 都城泉ヶ丘 | 17:36.89 | +3:41.16 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 32 | 黒木 一輝 | 宮崎北 | 17:44.34 | +3:48.61 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 33 | 谷口 輔 | 宮崎西 | 17:51.65 | +3:55.92 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 34 | 橋田 結歩 | 宮崎南 | 19:26.86 | +5:31.13 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 35 | 山﨑 遥斗 | 日向 | 20:29.38 | +6:33.65 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 36 | 井戸川侑督 | 日南振徳 | 20:53.70 | +6:57.97 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 37 | 尾﨑 晄来 | 延岡工業 | 21:47.72 | +7:51.99 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |