| 1 | 大場 崇義 | 城西大学 | 3:46.68 | | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 2 | 大門 晃士 | 早大同 | 3:47.03 | +0.35 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 3 | 橋本 健市 | 城西大学 | 3:48.22 | +1.54 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 4 | 齋藤 一筋 | 創価大学 | 3:48.70 | +2.02 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 5 | 関野 大空 | 明治学院大学 | 3:49.99 | +3.31 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 6 | 平野 音郁 | 亜細亜大学 | 3:51.60 | +4.92 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 7 | 成沢 翔英 | 慶應義塾大学 | 3:51.77 | +5.09 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 8 | 小野 太廊 | 日本体育大学 | 3:53.48 | +6.80 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 9 | 野間 黎矢 | 神奈川大学 | 3:53.50 | +6.82 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 10 | 花井 日友雅 | 帝京大学 | 3:53.92 | +7.24 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
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| 11 | 成田 太陽 | 拓殖大学 | 3:54.60 | +7.92 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 12 | 湧川 辰哉 | 関東学院大学 | 3:56.17 | +9.49 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 13 | 庄司 孔 | 東京国際大学 | 3:57.41 | +10.73 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 14 | 吉岡 龍一 | 千葉陸協 | 3:57.64 | +10.96 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 15 | 岩崎 輝翔 | 帝京大学 | 3:58.33 | +11.65 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 16 | 遠藤 煌斗 | 日本体育大学 | 3:58.39 | +11.71 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 17 | 金森 晴音 | 立命館大学 | 3:59.10 | +12.42 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 18 | 森 陸飛 | 帝京大学 | 4:00.05 | +13.37 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 19 | 間 翔太 | 立教大学 | 4:01.65 | +14.97 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 20 | 井口 愁斗 | 東京国際大学 | 4:01.76 | +15.08 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 21 | 小黒 慧 | 日本体育大学 | 4:03.22 | +16.54 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 22 | 山田 望仁 | 東京大学 | 4:03.31 | +16.63 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 23 | 横内 駿 | 札幌学院大学 | 4:06.54 | +19.86 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 24 | 森田 歩充 | 帝京大学 | 4:09.02 | +22.34 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 25 | 砂川 大和 | 帝京大学 | 4:12.60 | +25.92 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 26 | 杉山 翔梧 | 湘南工科大学 | 4:16.56 | +29.88 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 27 | 鈴木 朝陽 | 東北大学 | 4:17.61 | +30.93 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 28 | 和佐田 拓海 | 育英大学 | 4:18.55 | +31.87 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
