| 1 | 宇藤 煌基 | 藤蔭高 | 4:00.35 | | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 2 | 渡邊 来希 | 早稲田佐賀 | 4:03.09 | +2.74 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 3 | 俵 匠生 | 長崎日本大学高 | 4:03.34 | +2.99 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 4 | 地内 爽流 | 鳥栖工高 | 4:03.38 | +3.03 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 5 | 中嶌 咲太 | 飯塚高 | 4:03.49 | +3.14 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 6 | 百田 好希 | 鎮西学院高校 | 4:03.54 | +3.19 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 7 | 少路 悠人 | 大分東明高校 | 4:04.38 | +4.03 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 8 | 篠﨑 未來 | 大分舞鶴高 | 4:05.60 | +5.25 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 9 | 市川 大貴 | 別府鶴見丘高 | 4:06.05 | +5.70 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 10 | 小野 景 | 大分西高 | 4:09.06 | +8.71 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
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| 11 | 林 龍之介 | 九州文化高 | 4:09.84 | +9.49 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 12 | 中田 裕隆 | 長崎日本大学高 | 4:10.17 | +9.82 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 13 | 畔津 大治郎 | 臼杵高 | 4:14.00 | +13.65 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 14 | 橋本 虎之介 | 鎮西学院高校 | 4:19.04 | +18.69 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 15 | 山中 栄樟 | 柳ケ浦高 | 4:23.26 | +22.91 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 16 | 森 健大朗 | 藤蔭高 | 4:24.17 | +23.82 | 県高校総体オープンの部 |
| 17 | 領家 虹心 | 福岡・福大若葉 | 4:27.28 | +26.93 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 18 | 光岡 琴奈 | 佐賀・白石 | 4:28.21 | +27.86 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 19 | 菅野 美波 | 筑紫女学園高 | 4:29.32 | +28.97 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 20 | 一木 亜美 | 東筑高 | 4:30.05 | +29.70 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 21 | 古賀 孟 | 藤蔭高 | 4:32.57 | +32.22 | 県高校総体オープンの部 |
| 22 | 朝野 流南 | キヤノン | 4:33.64 | +33.29 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 23 | 深水 陽香 | 大分西高 | 4:43.67 | +43.32 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 24 | 若林 美咲 | 大分東明高校 | 4:48.69 | +48.34 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 25 | 柴田 歌音 | 大分東明高校 | 4:56.52 | +56.17 | 県高校総体オープンの部 |
| 26 | 梶原 眞優 | 藤蔭高 | 5:08.59 | +1:08.24 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 27 | 内藤 凪紗 | 大分舞鶴高 | 5:13.09 | +1:12.74 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 28 | 尾野 実咲 | 大分舞鶴高 | 5:25.44 | +1:25.09 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 29 | 宮川 七海 | 大分豊府高 | 6:07.75 | +2:07.40 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |