| 1 | ジャネット ジェプコエチ | 倉敷高 | 8:48.23 | | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 2 | 芦田 和佳 | 立命館宇治 | 8:59.45 | +11.22 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 3 | 池野 絵莉 | 須磨学園高校 | 9:04.37 | +16.14 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 4 | 吉田 彩心 | 札幌創成高校 | 9:04.64 | +16.41 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 5 | 湯田 和未 | 学法石川高校 | 9:04.91 | +16.68 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 6 | 大谷 芽以 | 名城大学 | 9:07.21 | +18.98 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 7 | 福山 若奈 | 埼玉栄高校 | 9:08.87 | +20.64 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 8 | 細見 芽生 | 名城大学 | 9:10.47 | +22.24 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 9 | 川西 みち | 豊田自動織機 | 9:13.50 | +25.27 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 10 | ミリアム ジェリ | 仙台育英 | 9:14.29 | +26.06 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
|
| 11 | 谷 凪紗 | 豊川高校 | 9:14.47 | +26.24 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 12 | 瀬戸口 凜 | 神村学園 | 9:14.77 | +26.54 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 南條 愛歩 | 倉敷高 | 9:15.37 | +27.14 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 14 | 芦田 和佳 | 立命館宇治高校 | 9:15.47 | +27.24 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 15 | 河村 璃央 | 薫英女学院高校 | 9:16.00 | +27.77 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 16 | 木田 美緒莉 | 旭川龍谷高校 | 9:17.48 | +29.25 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 17 | 渡辺 光桃 | 仙台育英高校 | 9:20.74 | +32.51 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 18 | 小林 美友 | 立命館宇治高校 | 9:20.95 | +32.72 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 19 | 伊藤 愛波 | 桂高校 | 9:21.58 | +33.35 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 20 | 松本 瑠莉 | 宇都宮文星女高校 | 9:22.24 | +34.01 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 21 | 黒葛原 唯夏 | 薫英女学院高校 | 9:22.73 | +34.50 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 22 | 前田 二千翔 | 三浦学苑高校 | 9:24.18 | +35.95 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 23 | 杉森 由萌 | 中央中等高 | 9:25.11 | +36.88 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 24 | 鈴木 彩花 | 大東文化大学 | 9:25.70 | +37.47 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 25 | 石川 桃子 | 新潟明訓 | 9:25.76 | +37.53 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 26 | 半田 帆乃花 | 仙台育英高校 | 9:25.97 | +37.74 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 27 | 長谷川 采花 | 札幌山の手高校 | 9:26.48 | +38.25 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 28 | 佐々木 玲奈 | 筑紫女学園高 | 9:26.66 | +38.43 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 29 | 田畑 陽菜 | 長野東高校 | 9:26.71 | +38.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 30 | 菅原 心菜 | 小林 | 9:27.05 | +38.82 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 31 | 杤尾 佳穂 | 西京高 | 9:27.78 | +39.55 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 32 | 蒲生 悠桜 | 豊川高校 | 9:27.98 | +39.75 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 33 | 竹下 未悠 | 上水高校 | 9:28.27 | +40.04 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 34 | 篠田 心晴 | 美濃加茂高校 | 9:28.35 | +40.12 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 35 | 岡本 彩希 | 名城大学 | 9:29.18 | +40.95 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 36 | 金子 聖奈 | 須磨学園高校 | 9:29.22 | +40.99 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 37 | 松本 紗直 | 旭丘 | 9:31.36 | +43.13 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 38 | ドルーリー 朱瑛里 | 津山高校 | 9:31.56 | +43.33 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 39 | 黒葛原 唯夏 | 大阪薫英女学院高校 | 9:33.86 | +45.63 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 40 | 谷 凪紗 | 豊川 | 9:34.63 | +46.40 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 41 | 種 知里 | 須磨学園高校 | 9:35.16 | +46.93 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 42 | 岡﨑 萌々 | 中大附属横浜高校 | 9:35.39 | +47.16 | 日体大女子長距離競技会 |
| 43 | 北村 凜 | 岩谷産業 | 9:35.43 | +47.20 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 44 | 水野 花音 | 大阪桐蔭高 | 9:36.60 | +48.37 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 45 | 佐川 空 | 東北高校 | 9:36.79 | +48.56 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 46 | 渡辺 愛来 | 仙台育英高校 | 9:36.80 | +48.57 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 47 | 松田 悠楽 | 駒大高校 | 9:36.98 | +48.75 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 48 | 大熊 さわ | 福岡大学 | 9:37.43 | +49.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 49 | 朝野 流南 | 東大阪大敬愛高校 | 9:37.64 | +49.41 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 50 | 清水 りの | 新島学園高校 | 9:37.75 | +49.52 | 日体大女子長距離競技会 |
| 51 | 塚原 深結 | 宇都宮文星女子高校 | 9:37.88 | +49.65 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 52 | 立花 來星々 | しまむら | 9:38.02 | +49.79 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 53 | 黒葛原 唯夏 | 薫英女学院 | 9:40.48 | +52.25 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 54 | 土井 花 | 立命館宇治高校 | 9:42.90 | +54.67 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 55 | 龍尾 茉那 | 常葉大菊川高校 | 9:44.22 | +55.99 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 56 | 渡邉 理早子 | 佐倉高校 | 9:44.25 | +56.02 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 57 | 吉原 碧彩 | 千原台高 | 9:45.12 | +56.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 58 | 岡留 藍 | 愛知高校 | 9:45.57 | +57.34 | 日体大女子長距離競技会 |
| 59 | 森崎 愛実 | 青森山田高校 | 9:45.66 | +57.43 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 60 | 上島 円羅 | 鯖江高校 | 9:45.97 | +57.74 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 61 | 隈部 湊 | 須磨学園高校 | 9:47.29 | +59.06 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 62 | 合田 安伽梨 | 旭川龍谷高校 | 9:47.71 | +59.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 63 | 越智 愛奈 | 今治北高 | 9:48.40 | +1:00.17 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 64 | 豊田 晄子 | 四国学院大香川西高校 | 9:48.84 | +1:00.61 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 65 | 松原 こころ | 旭川龍谷高校 | 9:49.08 | +1:00.85 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 66 | 狩野 美羽音 | 北九州市立高 | 9:50.90 | +1:02.67 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 67 | 佐藤 優乃花 | 豊川高校 | 9:50.94 | +1:02.71 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 68 | 島野 星来 | 高川学園高校 | 9:51.03 | +1:02.80 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 69 | 橘山 煌良 | 仙台育英高校 | 9:51.37 | +1:03.14 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 70 | 神谷 弥音 | 人環大附属岡崎高校 | 9:51.65 | +1:03.42 | 日体大女子長距離競技会 |
| 71 | 村井 百佳 | キャノン | 9:51.68 | +1:03.45 | 日体大女子長距離競技会 |
| 72 | 中村 愛琉 | 北九州市立高 | 9:52.42 | +1:04.19 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 73 | 中島 絢音 | 鹿児島鹿児島高 | 9:52.57 | +1:04.34 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 74 | 野口 紗喜音 | 神村学園高校 | 9:53.02 | +1:04.79 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 75 | 田中 のん | 常磐高校 | 9:53.42 | +1:05.19 | 日体大女子長距離競技会 |
| 76 | 名里 奏夢 | 美方高校 | 9:53.69 | +1:05.46 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 77 | 竹村 ありさ | 三浦学苑高校 | 9:55.45 | +1:07.22 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 78 | 小林 惟芽 | 明桜高校 | 9:56.31 | +1:08.08 | 日体大女子長距離競技会 |
| 79 | 藤田 紅良 | 豊川高校 | 9:56.74 | +1:08.51 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 80 | 綱川 まい | 東京農業大学 | 9:56.84 | +1:08.61 | 日体大女子長距離競技会 |
| 81 | 弓山 由依乃 | 鹿児島銀行 | 9:57.04 | +1:08.81 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 82 | 齋藤 わかな | いわき秀英高校 | 9:57.16 | +1:08.93 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 83 | 池谷 凜 | 常葉大菊川高校 | 9:57.42 | +1:09.19 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 84 | 橋場 菜々華 | 市立松戸高校 | 9:57.89 | +1:09.66 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 85 | 大木 心夏 | 明星高校 | 9:58.09 | +1:09.86 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 86 | 嶋田 晴日 | 鹿児島銀行 | 9:58.33 | +1:10.10 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 87 | 松﨑 こはな | 青森山田高校 | 10:00.03 | +1:11.80 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 88 | 杉浦 華夏 | 岡崎城西 | 10:00.55 | +1:12.32 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 89 | 鎌田 鈴 | 法政大学第二高校 | 10:01.58 | +1:13.35 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 90 | 村井 百佳 | キヤノンアスリートクラブ九州 | 10:01.66 | +1:13.43 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 91 | 森田 ここ乃 | 愛知高校 | 10:01.67 | +1:13.44 | 日体大女子長距離競技会 |
| 92 | 福田 美緒 | 東京農業大学 | 10:04.95 | +1:16.72 | 日体大女子長距離競技会 |
| 93 | 大浦 陽奈乃 | 仙台育英高校 | 10:05.17 | +1:16.94 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 94 | 竹中 詩歩 | 坂戸西高校 | 10:06.19 | +1:17.96 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 95 | 木島 紗弥 | 加藤学園高校 | 10:06.99 | +1:18.76 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 96 | 峯下 優華 | 城ノ内中等高 | 10:07.51 | +1:19.28 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 97 | 伴場 瑠奈 | 常磐高校 | 10:08.24 | +1:20.01 | 日体大女子長距離競技会 |
| 98 | 小林 桜來 | 北海道栄高校 | 10:08.59 | +1:20.36 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 99 | 櫻井 みず紀 | 銚子高校 | 10:09.93 | +1:21.70 | 日体大女子長距離競技会 |
| 100 | 江頭 七海 | 同志社大学 | 10:11.71 | +1:23.48 | 第59回織田幹雄記念国際 |