| 1 | 山内 大矢 | 杵築高 | 8:42.45 | | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
| 2 | 久知良 勇翔 | 大分東明高校 | 9:14.09 | +31.64 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 3 | 中野 颯大 | 藤蔭高 | 9:16.63 | +34.18 | 県高校総体オープンの部 |
| 4 | 清田 航羽 | 大分東明高校 | 9:21.94 | +39.49 | 県高校総体オープンの部 |
| 5 | 袖 瑞希 | 大分東明高校 | 9:29.84 | +47.39 | 県高校総体オープンの部 |
| 6 | 大石 颯汰 | 鶴崎工高 | 9:31.53 | +49.08 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 7 | 江藤 優樹 | 藤蔭高 | 9:31.99 | +49.54 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 8 | 平野 翔真 | 大分東明高校 | 9:34.06 | +51.61 | 県高校総体オープンの部 |
| 9 | 本田 佳穂 | 長崎・長崎商 | 9:34.83 | +52.38 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 10 | 福嶋 円嘉 | 大分東明高校 | 9:40.47 | +58.02 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
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| 11 | 德永 三香子 | 大分東明高校 | 9:41.33 | +58.88 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 12 | 德永 三香子 | 大分・大分東明 | 9:45.95 | +1:03.50 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 13 | 花田 愛海 | 大分東明高校 | 9:46.67 | +1:04.22 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 14 | 花田 愛海 | 大分・大分東明 | 9:48.36 | +1:05.91 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 15 | 岡村 悠花 | 北九州市立高 | 9:54.32 | +1:11.87 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 16 | 白根 拓馬 | 大分舞鶴高 | 9:58.45 | +1:16.00 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 17 | 福嶋 円嘉 | 大分・大分東明 | 9:59.34 | +1:16.89 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 18 | 山本 蒼介 | 大分雄城台高 | 10:07.36 | +1:24.91 | 2026年度 第１回春季陸上競技大会 |
| 19 | 甲斐 一真 | 大分上野丘高 | 10:20.20 | +1:37.75 | 県高校総体オープンの部 |
| 20 | 中村 心美 | 諫早 | 10:21.05 | +1:38.60 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 21 | 藤井 碧波 | 別府鶴見丘高 | 10:27.35 | +1:44.90 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 22 | 佐藤 叶琉 | 別府鶴見丘高 | 10:29.43 | +1:46.98 | トップアスリート大分プロジェクト 第80回大分県陸上競技選手権大会 |
| 23 | 田村 裕菜 | 大分東明高校 | 10:34.00 | +1:51.55 | 県高校総体オープンの部 |
| 24 | 高田 希美 | 藤蔭高 | 10:42.40 | +1:59.95 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |
| 25 | 園田 華麗 | 佐賀・白石 | 10:48.23 | +2:05.78 | 第79回全国高等学校陸上競技対校選手権大会 北九州地区予選会 |
| 26 | 福田 瑞季 | 大分雄城台高 | 11:15.51 | +2:33.06 | 第74回 大分県高等学校総合体育大会 |