| 1 | 渡邉 陽仁 | 彦根翔西館高 | 8:55.91 | | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 2 | 畑 仁智甫 | 膳所高 | 9:12.53 | +16.63 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 3 | 村井 和果 | 薫英女学院 | 9:13.32 | +17.41 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 4 | 尾﨑 一樺 | 智辯カレッジ高 | 9:26.74 | +30.83 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 5 | 谷口 楓 | 京都外大西高校 | 9:29.59 | +33.68 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 6 | 田中 一伽 | 福知山成美 | 9:29.84 | +33.94 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 7 | 長谷川 莉都 | 東大阪大敬愛高校 | 9:31.89 | +35.98 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 8 | 上川 瑞稀 | 近江高 | 9:35.61 | +39.70 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 9 | 今村 蒼空 | 甲西高 | 9:35.96 | +40.06 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 10 | 西嶋 龍世 | 長浜北高 | 9:36.19 | +40.28 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
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| 11 | 森本 杏 | 智辯カレッジ高 | 9:37.57 | +41.66 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 12 | 山元 優太 | 滋賀短大附高 | 9:39.37 | +43.47 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 13 | 山本 伊吹 | 彦根翔西館高 | 9:40.03 | +44.12 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 14 | 奥田 涼太郎 | 八日市高 | 9:41.00 | +45.09 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 15 | 石原 聡太 | 守山高 | 9:47.05 | +51.14 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 16 | 宮﨑 千夏 | 西京高 | 9:48.63 | +52.73 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 17 | 各務 瑛太 | 彦根東高 | 9:49.67 | +53.77 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 18 | 松岡 奏空 | 甲西高 | 9:50.67 | +54.77 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 19 | 里内 香音 | 比叡山高 | 9:51.41 | +55.50 | 令和8年度春季高等学校総合体育大会 |
| 20 | 阿曽 杏香 | 市西宮高 | 9:52.12 | +56.22 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 21 | 小林 心桜 | 京都外大西高校 | 9:52.83 | +56.92 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 22 | 西川 遼 | 近江高 | 9:52.86 | +56.95 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 23 | 福田 青生 | 智辯カレッジ高 | 9:53.96 | +58.06 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 24 | 長谷川 結都 | 東大阪大敬愛高校 | 9:55.54 | +59.63 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 25 | 大﨑 真之介 | 立命館守山高 | 9:55.83 | +59.92 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 26 | 前田 大和 | 草津高 | 10:05.19 | +1:09.28 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 27 | 葛川 宗佑 | 長浜北高 | 10:05.42 | +1:09.51 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 28 | 中村 浩太 | 瀬田工高 | 10:11.11 | +1:15.20 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 29 | 牛谷 和士 | 虎姫高 | 10:14.30 | +1:18.39 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 30 | 西村 美羽菜 | 須磨学園高校 | 10:15.55 | +1:19.64 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 31 | 溜池 梨乃 | 草津東高 | 10:21.64 | +1:25.74 | 令和8年度春季高等学校総合体育大会 |
| 32 | 山田 結芽 | ヌヴェール学院高 | 10:23.84 | +1:27.93 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 33 | 堀内 朝斗 | 守山高 | 10:27.03 | +1:31.12 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 34 | 﨑谷 結芽 | 西脇工高 | 10:30.71 | +1:34.80 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 35 | 室之園 英斗 | 甲西高 | 10:35.52 | +1:39.62 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 36 | 山村 芽衣奈 | 橋本高 | 10:35.70 | +1:39.80 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 37 | 玄素 沙永子 | 智辯和歌山高 | 10:37.01 | +1:41.10 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 38 | 福元 みずき | 智辯和歌山高 | 10:39.35 | +1:43.44 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 39 | 西田 泰輔 | 守山高 | 10:43.11 | +1:47.20 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 40 | 川手 菜央 | 日高 | 10:51.84 | +1:55.93 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 41 | 能海 茉莉 | 草津東高 | 11:03.95 | +2:08.04 | 令和8年度春季高等学校総合体育大会 |
| 42 | 内藤 裟絢 | 長浜北高 | 11:04.71 | +2:08.80 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 43 | 服部 奈緒 | 育英西 | 11:08.08 | +2:12.18 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 44 | 樋脇 佑真 | 八幡工高 | 11:16.37 | +2:20.47 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 45 | 三浦 綺華 | 奈良育英高 | 11:18.38 | +2:22.48 | 令和8年度全国高等学校総合体育大会近畿地区予選会 |
| 46 | 目秦 舞衣 | 守山高 | 11:40.72 | +2:44.82 | 第4回Castle Carnival in HIKONE |
| 47 | 矢野 芭音 | 水口高 | 11:52.02 | +2:56.11 | 令和8年度春季高等学校総合体育大会 |
| 48 | 和田 芹奈 | 水口東高 | 12:20.85 | +3:24.94 | 令和8年度春季高等学校総合体育大会 |