| 1 | 谷山 凌太 | 宮崎小林 | 9:08.84 | | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 2 | 荒木 琉偉高2 | 小林高校 | 9:11.58 | +2.74 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 3 | 福田 幸誠高3 | 小林高校 | 9:26.35 | +17.51 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 4 | 河野 柊輝 | 宮崎日章学園 | 9:49.44 | +40.60 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 5 | 春成 奏輝 | 宮崎都城西 | 9:58.70 | +49.86 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 6 | 九平 來鷲 | 宮崎都城工 | 10:13.62 | +1:04.78 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 7 | 宮﨑 俊輔 | 宮崎北 | 10:14.11 | +1:05.27 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 8 | 松尾 奏汰 | 宮崎西 | 10:30.26 | +1:21.42 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 9 | 中村 騎士高1 | 宮崎工業 | 10:31.00 | +1:22.16 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 10 | 山下 勇星高3 | 延岡商業 | 10:36.23 | +1:27.39 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
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| 11 | 今村 瑛太 | 都城泉ヶ丘 | 10:36.36 | +1:27.52 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 12 | 松本 青龍 | 日向 | 10:42.58 | +1:33.74 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 13 | 八木 海音 | 宮崎北 | 10:54.63 | +1:45.79 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 14 | 安楽 航太 | 都城西 | 10:56.09 | +1:47.25 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 15 | 寿崎 舜高3 | 延岡商業 | 10:56.74 | +1:47.90 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 16 | 清田 逞湊高1 | 延岡商業 | 11:00.00 | +1:51.16 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 17 | 工藤 優心 | 宮崎北 | 11:06.43 | +1:57.59 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 18 | 森 遥人高2 | 大牟田高 | 11:06.96 | +1:58.12 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 19 | 神塚 椋大高1 | 延岡工業 | 11:13.47 | +2:04.63 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 20 | 中村 風吹高1 | 宮崎工業 | 11:25.84 | +2:17.00 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 21 | 長野 晴太 | 宮崎西 | 11:31.60 | +2:22.76 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 22 | 柿田 俊輔 | 門川 | 11:37.11 | +2:28.27 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 23 | 前田 輝 | 宮崎西 | 11:37.40 | +2:28.56 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |
| 24 | 梶原 理央高1 | 延岡工業 | 11:55.43 | +2:46.59 | 第53回宮崎県高等学校総合体育大会 第79回陸上競技大会 |