| 1 | 新家 裕太郎 | 愛三工業 | 8:25.43 | | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 2 | フィレモン キプラガット | 愛三工業 | 8:25.87 | +0.44 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 3 | 楠 康成 | 阿見AC | 8:27.35 | +1.92 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 4 | 佐々木 哲大1 | 早稲田大学 | 8:29.05 | +3.62 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 5 | 砂田 晟弥 | SUBARU | 8:29.11 | +3.68 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 6 | 永原 颯磨大2 | 順天堂大学 | 8:29.35 | +3.92 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 6 | 青木 涼真 | Honda | 8:29.35 | +3.92 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 8 | 小野 真忠大2 | 東海大学 | 8:32.54 | +7.11 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 9 | 谷口 辰煕 | NTN | 8:32.67 | +7.24 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 10 | 小原 響 | GMOインターネットGrp | 8:35.84 | +10.41 | 第59回織田幹雄記念国際 |
|
| 11 | 佐藤 颯 | 富士山の銘水 | 8:36.60 | +11.17 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 12 | 湯田 陽平兵大2 | 法政大学 | 8:37.53 | +12.10 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 13 | ソロモン ムトゥク | 創価大学 | 8:38.89 | +13.46 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 14 | PHILEMON Kiplagat | 愛三工業 | 8:39.04 | +13.61 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本グランプリシリーズ 神戸大会 |
| 15 | 小原 響 | GMOインターネ | 8:39.29 | +13.86 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 16 | 佐竹 勇樹 | トーエネック | 8:43.77 | +18.34 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 17 | 西方 大珠 | 愛三工業 | 8:44.16 | +18.73 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本グランプリシリーズ 神戸大会 |
| 18 | 黒木 陽向大4 | 創価大学 | 8:44.25 | +18.82 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 19 | 緒方 快大4 | 関東学院大学 | 8:45.52 | +20.09 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 20 | 加藤 結羽高3 | 佐久長聖高校 | 8:45.77 | +20.34 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 21 | 古賀 想太 | 市立前橋 | 8:46.95 | +21.52 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 22 | 中園 慎太朗 | 埼玉医科大学G | 8:47.02 | +21.59 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 23 | 前田 結人高3 | 洛南高校 | 8:48.11 | +22.68 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 24 | 大園倫太 郎 | 戸上電機製作所 | 8:49.81 | +24.38 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本グランプリシリーズ 神戸大会 |
| 25 | 伊藤 要大4 | 山梨学院大学 | 8:49.85 | +24.42 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 26 | 湯田陽平 兵 | 法政大学 | 8:51.58 | +26.15 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 27 | 大園 倫太郎 | 戸上電機製作所 | 8:51.96 | +26.53 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 28 | 花谷 そら | JR九州 | 8:52.51 | +27.08 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本グランプリシリーズ 神戸大会 |
| 29 | 徳山 博貴 | 中央大学 | 8:53.04 | +27.61 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 30 | 伊藤 悠ノ介 | 八千代松陰 | 8:54.35 | +28.92 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 31 | 辻 昂介大2 | 順天堂大学 | 8:54.74 | +29.31 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 32 | ソロモン ムトゥク | 創価大学連 | 8:56.22 | +30.79 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 33 | 安田 陸人大3 | 慶應義塾大学 | 8:56.23 | +30.80 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 34 | 佐藤 颯 | 富士山GX | 8:56.31 | +30.88 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 34 | 竹信 祐太郎高2 | 福工大城東高 | 8:56.31 | +30.88 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 36 | 岸本 莞爾 | 駒澤大学 | 8:56.67 | +31.24 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 37 | 橋本 健市大2 | 城西大学 | 8:56.88 | +31.45 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 38 | 樋熊 悠翔 | 埼大学連 | 8:57.02 | +31.59 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 38 | 樋熊 悠翔 | 埼玉大学 | 8:57.02 | +31.59 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 40 | 三浦 琥亜 | 一関学院 | 8:57.13 | +31.70 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 41 | 原田 颯大 | 立教大学 | 8:57.18 | +31.75 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 42 | 牟田 颯太大2 | 駒澤大学 | 8:57.25 | +31.82 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 43 | 伊藤 魁良 | 立命館大学 | 8:57.78 | +32.35 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 44 | 牟田 颯太 | 駒大 | 8:58.25 | +32.82 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 45 | 佐々木 哲 | 早大 | 8:58.38 | +32.95 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 46 | 西澤マハ ロ | 青山学院大学 | 8:58.79 | +33.36 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 46 | 西澤マハ ロ | 青学大学連 | 8:58.79 | +33.36 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 48 | 湯田陽平 兵 | 法大学連 | 8:59.12 | +33.69 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 49 | 天瀬 海斗 | 日本体育大学 | 8:59.14 | +33.71 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 49 | 天瀬 海斗 | 日体大 | 8:59.14 | +33.71 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 51 | 小野 真忠 | 東海大学連 | 8:59.16 | +33.73 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 52 | 伊藤 要 | 山梨学大 | 8:59.40 | +33.97 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 53 | 緒方 快 | 関東学院大 | 8:59.44 | +34.01 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 54 | 小川 隼登大2 | 東洋大学 | 8:59.64 | +34.21 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 55 | 稲木 祐人大3 | 上武大学 | 8:59.67 | +34.24 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 55 | 稲木 祐人 | 上武大 | 8:59.67 | +34.24 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 57 | 南葉 聖琥 | 山梨学院大学 | 8:59.88 | +34.45 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 58 | 大谷 謙心 | 埼玉栄 | 9:00.09 | +34.66 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 59 | 山口 慶人 | 順天堂大学 | 9:00.45 | +35.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 60 | 黒木 陽向 | 創価大学連 | 9:00.48 | +35.05 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 61 | 足立 華紀 | 立正大学 | 9:00.73 | +35.30 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 61 | 足立 華紀 | 立正大学連 | 9:00.73 | +35.30 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 63 | 岸本 晟高3 | 京都外大西高校 | 9:00.75 | +35.32 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 64 | 小松 駿太 | 拓大学連 | 9:00.90 | +35.47 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 64 | 小松 駿太 | 拓殖大学 | 9:00.90 | +35.47 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 66 | 原田 颯大 | 立大 | 9:01.13 | +35.70 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 67 | 本間 創大3 | 青山学院大学 | 9:01.77 | +36.34 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 67 | 本間 創 | 青学大 | 9:01.77 | +36.34 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 69 | 高舘 友杜 | 早稲田大学 | 9:01.97 | +36.54 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 70 | 高橋 重陽 | - | 9:02.06 | +36.63 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 70 | 高橋 重陽 | - | 9:02.06 | +36.63 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 70 | 高橋 重陽 | 平成国大学 | 9:02.06 | +36.63 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 70 | 高橋 重陽 | - | 9:02.06 | +36.63 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 74 | 野木 琉平 | 西練 | 9:02.07 | +36.64 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 75 | 鶴留 唯月 | 小林 | 9:02.08 | +36.65 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 76 | 村田 幸翼 | 國學院大 | 9:02.16 | +36.73 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 76 | 村田 幸翼 | 國學院大学 | 9:02.16 | +36.73 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 78 | 藤井 達希大3 | 駿河台大学 | 9:02.19 | +36.76 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 78 | 藤井 達希 | 駿河台大 | 9:02.19 | +36.76 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 80 | 西田龍希 亜 | 帝京大学 | 9:02.43 | +37.00 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 80 | 西田龍希 亜 | 帝京大 | 9:02.43 | +37.00 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 82 | 木村 啓運 | 萩 | 9:02.59 | +37.16 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 83 | 鍜冶進之 介 | 亜大学連 | 9:02.94 | +37.51 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 83 | 鍜冶進之 介 | 亜細亜大学 | 9:02.94 | +37.51 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 85 | 辻 昂介 | 順大学連 | 9:03.02 | +37.59 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 86 | 吉田 光汰 | 千葉陸協 | 9:03.25 | +37.82 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 87 | 佐伯 優月高3 | 西脇工高 | 9:03.30 | +37.87 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 88 | 松山 怜平高3 | 奈良育英高 | 9:03.72 | +38.29 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 89 | 北浦 拓真高3 | 聖和学園高校 | 9:03.83 | +38.40 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 90 | 星野 愁高3 | 中越高校 | 9:04.28 | +38.85 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 91 | 江藤 大輝 | 立教大学 | 9:04.33 | +38.90 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 92 | 小林 歩夢高3 | 川崎市立橘高校 | 9:04.45 | +39.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 93 | 小川 隼登 | 東洋大 | 9:04.78 | +39.35 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 94 | 西塚 璃純大4 | 札幌学院大学 | 9:04.86 | +39.43 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 95 | 森松 彩夢高2 | 一関学院高校 | 9:05.50 | +40.07 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 95 | 福西 和希高3 | 岡崎城西高校 | 9:05.50 | +40.07 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 97 | 安田 陸人 | 慶大 | 9:05.64 | +40.21 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 98 | 南葉 聖琥 | 山梨学大 | 9:06.01 | +40.58 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 99 | 小早川凌 真 | 城西大学 | 9:06.56 | +41.13 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 99 | 小早川凌 真 | 城西大学連 | 9:06.56 | +41.13 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |