| 1 | フェリックス ムティアニ高3 | 山梨学院高校 | 1:48.65 | | 第79回国民スポーツ大会 |
| 2 | 渡辺 敦紀 | 筑波大学 | 1:49.23 | +0.58 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 3 | 鈴木 太智高3 | 中京大中京高校 | 1:49.30 | +0.65 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 4 | 菊池 晴太 | 盛岡第四 | 1:49.45 | +0.80 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 5 | 森 亮太高3 | 美濃加茂高校 | 1:49.67 | +1.02 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 6 | 小河原 史博高3 | 古河中等高 | 1:50.46 | +1.81 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 7 | 梅原 俊太高3 | 学法石川高校 | 1:51.12 | +2.47 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 8 | 衣笠 逞真高3 | 奈良高 | 1:51.19 | +2.54 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 9 | 林 聖也 | 九州共立大学 | 1:52.07 | +3.42 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 10 | 茂籠 和生高1 | 関西創価高 | 1:52.42 | +3.77 | 第79回国民スポーツ大会 |
|
| 11 | 西 祐杜 | 同志社大学 | 1:52.53 | +3.88 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 12 | 鶴田 宇大高3 | 瓊浦高 | 1:53.04 | +4.39 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 13 | 布施川 大梧高1 | 東京農大二高校 | 1:53.26 | +4.61 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 14 | 地内 爽流 | 鳥栖工業 | 1:53.52 | +4.87 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 15 | 竹下 朋希 | 岡山大学 | 1:53.74 | +5.09 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 16 | 和田 信之介ヤシン高3 | 佐渡高 | 1:53.85 | +5.20 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 17 | 三枝 琥珀 | 京都産業大学 | 1:54.13 | +5.48 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 18 | 三好 悠太 | 宇和 | 1:54.26 | +5.61 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 19 | 前田 晃汰高3 | 聖和学園高校 | 1:54.54 | +5.89 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 20 | 大森 友敬高2 | 七尾高 | 1:54.76 | +6.11 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 21 | 堀内 盟 | 秋田中央 | 1:56.10 | +7.45 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 22 | 安井 靖射高2 | 大津商高 | 1:56.55 | +7.90 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 23 | 石塚 雅大高3 | 市立船橋高校 | 1:56.64 | +7.99 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 24 | 山根 爽楽 | 鳥取城北 | 1:57.00 | +8.35 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 25 | 渡邉 陽仁高2 | 彦根翔西館高 | 1:58.01 | +9.36 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 26 | 髙橋 琉希高2 | 大津商高 | 1:58.57 | +9.92 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 27 | 吉田 裕心高2 | 札幌創成高校 | 1:59.11 | +10.46 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 28 | 西村 悠也高2 | 水口東高 | 1:59.24 | +10.59 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 29 | 畑 仁智甫高2 | 膳所高 | 1:59.78 | +11.13 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 30 | 竹内 莉晄高2 | 草津高 | 2:00.59 | +11.94 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 31 | 大畑 裕一朗高2 | 智辯和歌山高 | 2:01.66 | +13.01 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 32 | 福永 怜央高2 | 長浜北高 | 2:02.79 | +14.14 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 33 | 水野 遥翔高2 | 甲西高 | 2:02.95 | +14.30 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 34 | 畔柳 圭佑高1 | 草津東高 | 2:03.58 | +14.93 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 35 | 吉本 光汰高2 | 幸福関西高 | 2:03.70 | +15.05 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 36 | 森澤 楽高1 | 石山高 | 2:04.14 | +15.49 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 37 | 福本 瑛士高2 | 彦根東高 | 2:05.15 | +16.50 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 38 | 岡野 太智高2 | 膳所高 | 2:05.28 | +16.63 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 39 | 田中 孝太郎高2 | 八幡工高 | 2:05.49 | +16.84 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 40 | 重永 瑛太高2 | 東大津高 | 2:06.13 | +17.48 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 41 | 奥田 涼太郎高2 | 八日市高 | 2:06.74 | +18.09 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 42 | 白井 佑季高2 | 光泉カトリック高 | 2:07.04 | +18.39 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 43 | 葛川 宗佑高2 | 長浜北高 | 2:08.11 | +19.46 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 44 | 荒木 睦桔高2 | 水口東高 | 2:08.53 | +19.88 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 45 | 中北 洸太高2 | 八幡工高 | 2:08.57 | +19.92 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 46 | 岡田 隆之介高2 | 水口東高 | 2:09.77 | +21.12 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 47 | 平尾 憲照高1 | 八幡高 | 2:10.86 | +22.21 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 48 | 牛谷 和士高2 | 虎姫高 | 2:11.00 | +22.35 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 49 | 光岡 翼高2 | 八幡商高 | 2:11.28 | +22.63 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 50 | 清水 陽太 | 高島 | 2:12.66 | +24.01 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 51 | 中川 雄心高2 | 彦根東高 | 2:13.55 | +24.90 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 52 | 小葉 海人高1 | 近江高 | 2:14.77 | +26.12 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 53 | 八田 凌真高1 | 守山高 | 2:15.13 | +26.48 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 54 | 山本 聖太高1 | 彦根翔西館高 | 2:16.69 | +28.04 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 55 | 辻 詩雅高2 | 八日市高 | 2:17.96 | +29.31 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 56 | 福山 隼矢高1 | 日野高 | 2:20.63 | +31.98 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 57 | 岡田 圭祐高1 | 石山高 | 2:23.11 | +34.46 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 58 | 下村 駿高1 | 彦根東高 | 2:23.58 | +34.93 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 59 | 髙倉 暖磨高2 | 八日市高 | 2:24.08 | +35.43 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 60 | 野村 柊仁高2 | 八幡商高 | 2:26.12 | +37.47 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 61 | 樋脇 佑真高2 | 八幡工高 | 2:28.69 | +40.04 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 62 | 小林 拓斗高1 | 水口東高 | 2:39.30 | +50.65 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 63 | 竹内 蒼空高1 | 長浜北高 | 2:42.04 | +53.39 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |