| 1 | 長森 結愛 | 仙台育英高校 | 9:04.77 | | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 2 | ムリティ マーシー | 神村学園高校 | 9:12.74 | +7.97 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 3 | 黒川 志帆 | 仙台育英高校 | 9:13.41 | +8.64 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 4 | メリー ムソニ | 青森山田高校 | 9:14.28 | +9.51 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 5 | 大石 蒼依 | 仙台育英高校 | 9:14.29 | +9.52 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 6 | 瀬戸口 恋空 | 神村学園高校 | 9:19.57 | +14.80 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 7 | 藤澤 心々 | 共愛学園高校 | 9:22.67 | +17.90 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 8 | 黒川 志帆 | 仙台育英 | 9:24.53 | +19.76 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 9 | 南村 京伽 | 立命館宇治高校 | 9:26.01 | +21.24 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 10 | 田谷 玲 | 大阪薫英女学院高校 | 9:26.60 | +21.83 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
|
| 11 | 井上 穂奏 | 東海大相模高校 | 9:26.91 | +22.14 | 日体大女子長距離競技会 |
| 12 | 谷内 七海 | 東大阪大敬愛高校 | 9:27.33 | +22.56 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 13 | 本田 結彩 | 長野東高校 | 9:27.44 | +22.67 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 14 | 武田 星莉 | 神村学園高校 | 9:28.92 | +24.15 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 15 | 大石 蒼依 | 仙台育英 | 9:29.79 | +25.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 16 | 田谷 玲 | 薫英女学院高校 | 9:30.74 | +25.97 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 17 | 東 心絆 | 銀河学院 | 9:31.33 | +26.56 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 18 | 長島 彩音 | 宇都宮文星女子高校 | 9:31.41 | +26.64 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 18 | 本田 佳穂 | 長崎商高 | 9:31.41 | +26.64 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 伊藤 彩由奈 | 須磨学園高校 | 9:31.74 | +26.97 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 21 | 武田 星莉 | 鹿児島神村学園 | 9:34.24 | +29.47 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 22 | 鴨狩 侑奈 | 錦城学園高校 | 9:35.60 | +30.83 | 日体大女子長距離競技会 |
| 23 | 近藤 楓香 | 東大阪大敬愛高校 | 9:35.77 | +31.00 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 24 | 池野 芹梨 | 須磨学園高校 | 9:35.83 | +31.06 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 25 | 本澤 怜望 | 宇都宮文星女子高校 | 9:36.22 | +31.45 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 26 | 村松 帆乃美 | 東海大相模高校 | 9:36.80 | +32.03 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 27 | 寺元 咲結 | 坂戸西高校 | 9:37.53 | +32.76 | 日体大女子長距離競技会 |
| 28 | 三宅 凜 | 広島工大高校 | 9:38.72 | +33.95 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 29 | 山本 留衣 | 東大阪大敬愛高校 | 9:38.88 | +34.11 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 30 | 白鳥 光姫 | 札幌山の手高校 | 9:41.20 | +36.43 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 31 | 井上 佳奈 | 山形城北 | 9:42.21 | +37.44 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 32 | 岡村 悠花 | 北九州市立高 | 9:42.75 | +37.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 33 | 石田 萌愛菜 | 青森山田高校 | 9:42.91 | +38.14 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 34 | 櫛渕 光愛 | 白鵬女子高校 | 9:43.24 | +38.47 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 35 | 石原 万結 | 仙台育英高校 | 9:44.09 | +39.32 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 36 | 大泉 はなの | 花巻東高校 | 9:44.54 | +39.77 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 37 | 田中 優奈 | 柏崎翔洋中等高校 | 9:45.45 | +40.68 | 日体大女子長距離競技会 |
| 38 | 中村 うら蘭 | 春日部女子高校 | 9:45.58 | +40.81 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 39 | 守屋 咲希 | 成田高校 | 9:45.77 | +41.00 | 日体大女子長距離競技会 |
| 40 | 小林 彩音 | 駒大高校 | 9:45.90 | +41.13 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 41 | 朝倉 萌衣 | 旭川龍谷高校 | 9:45.98 | +41.21 | 日体大女子長距離競技会 |
| 42 | 隅田 美月 | 豊川高校 | 9:46.38 | +41.61 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 43 | 本田 瑞希 | 東海大相模高校 | 9:47.93 | +43.16 | 日体大女子長距離競技会 |
| 44 | 日下 琉楓 | 学法石川高校 | 9:48.04 | +43.27 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 45 | 加藤 紗彩 | 愛知高校 | 9:48.68 | +43.91 | 日体大女子長距離競技会 |
| 46 | 瀬戸口 恋空 | 鹿児島神村学園 | 9:48.95 | +44.18 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 47 | 柏木 ことみ | 東海大相模高校 | 9:48.98 | +44.21 | 日体大女子長距離競技会 |
| 48 | 森田 華音 | 長野東高校 | 9:49.63 | +44.86 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 49 | 脇坂 梨王南 | 須磨学園高校 | 9:49.78 | +45.01 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 50 | 研屋 杏虹 | 稲生高校 | 9:50.58 | +45.81 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 51 | 上野 愛夏 | 城西大城西高校 | 9:51.26 | +46.49 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 52 | 荻野 珠琳 | 鯖江高校 | 9:51.67 | +46.90 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 53 | 田口 心愛 | 城西大城西高校 | 9:52.66 | +47.89 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 54 | 菊池 里咲 | 花巻東高校 | 9:52.71 | +47.94 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 55 | 大塚 結衣 | 鯖江高校 | 9:53.18 | +48.41 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 56 | 鈴木 莉央 | 市立松戸高校 | 9:53.38 | +48.61 | 日体大女子長距離競技会 |
| 57 | 山下 想和 | 東海大相模高校 | 9:53.76 | +48.99 | 日体大女子長距離競技会 |
| 58 | 北村 玲華 | 駒大高校 | 9:54.79 | +50.02 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 59 | 大西 菜南子 | 大阪桐蔭高 | 9:55.05 | +50.28 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 59 | 阿部 帆夏 | 常磐高校 | 9:55.05 | +50.28 | 日体大女子長距離競技会 |
| 61 | 長谷川 埜恵 | 城西大城西高校 | 9:55.73 | +50.96 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 62 | 新谷 恵麻 | 山田 | 9:55.84 | +51.07 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 63 | 浦山 美咲 | 豊川高校 | 9:56.69 | +51.92 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 64 | 奥村 望愛 | 鯖江高校 | 9:56.76 | +51.99 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 65 | 仲村 日和 | 美方高校 | 9:57.71 | +52.94 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 66 | 八木沢 惟 | 那須拓陽高校 | 9:57.97 | +53.20 | 日体大女子長距離競技会 |
| 67 | 不破 珠衣琉 | 健大高崎高校 | 9:58.35 | +53.58 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 68 | 堀井 瑚瑚 | 駒大高校 | 9:58.69 | +53.92 | 日体大女子長距離競技会 |
| 69 | 崎谷 結芽 | 西脇工業高 | 9:58.90 | +54.13 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 70 | 角 侑哩 | 西脇工業高 | 9:58.92 | +54.15 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 71 | 香川 莉奈 | 札幌山の手高校 | 9:59.78 | +55.01 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 72 | 鴨狩 侑芽 | 錦城学園高校 | 10:00.30 | +55.53 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 73 | 大森 心愛 | 宇都宮文星女子高校 | 10:01.15 | +56.38 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 74 | 福嶋 円嘉 | 大分東明高校 | 10:01.61 | +56.84 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 75 | 東山 心結 | 津商業高校 | 10:01.95 | +57.18 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 76 | 蓬田 珠央梨 | 宇都宮文星女子高校 | 10:02.03 | +57.26 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 77 | 奥野 結月 | 錦城学園高校 | 10:02.07 | +57.30 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 78 | 萩原 咲良 | 銀河学院 | 10:02.52 | +57.75 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 79 | 飯島 涼 | 荏田高校 | 10:03.63 | +58.86 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 80 | 大矢 莉子 | 専修大松戸高校 | 10:04.04 | +59.27 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 81 | 菊池 恵愛 | 花巻東高校 | 10:04.16 | +59.39 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 82 | 阿部 ゆりあ | 学法石川高校 | 10:04.49 | +59.72 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 83 | 足達 結依 | 成田高校 | 10:04.81 | +1:00.04 | 日体大女子長距離競技会 |
| 84 | 浪岡 知聖 | 青森山田高校 | 10:04.99 | +1:00.22 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 85 | 廣田 みちる | 城西大城西高校 | 10:05.15 | +1:00.38 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 86 | 西山 楓 | 西脇工業高 | 10:05.57 | +1:00.80 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 87 | 荻 ひまり | 常葉大菊川高校 | 10:06.58 | +1:01.81 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 88 | 佐々木 百優 | 札幌山の手高校 | 10:06.80 | +1:02.03 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 89 | 新井 璃桜 | 市立橘高校 | 10:07.23 | +1:02.46 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 90 | 村松 留名 | 浜松工業高校 | 10:07.57 | +1:02.80 | 日体大女子長距離競技会 |
| 91 | 細川 瑠花 | 旭川龍谷高校 | 10:07.64 | +1:02.87 | 日体大女子長距離競技会 |
| 92 | 川村 ひばり | 青森山田高校 | 10:08.52 | +1:03.75 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 93 | 長澤 杏 | 韮崎高校 | 10:09.39 | +1:04.62 | 日体大女子長距離競技会 |
| 94 | 日下部 小春 | 長野東高校 | 10:10.94 | +1:06.17 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 95 | 谷口 友彩 | 光明相模原高校 | 10:11.10 | +1:06.33 | 日体大女子長距離競技会 |
| 96 | 鳴海 詩音 | 旭川龍谷高校 | 10:11.95 | +1:07.18 | 日体大女子長距離競技会 |
| 97 | 柳 琴都 | 法政二高校 | 10:12.73 | +1:07.96 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 98 | 稲葉 心優 | 常磐高校 | 10:13.64 | +1:08.87 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 99 | 竹之下 舞帆 | 学法石川高校 | 10:14.01 | +1:09.24 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 100 | 柳 琴都 | 法政大学第二高校 | 10:14.23 | +1:09.46 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |