| 1 | チェボティビン カドゴ | 埼玉医科大学G | 9:06.29 | | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 2 | ワンジル サラ | 大東文化大学 | 9:06.40 | +0.11 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 3 | 田島 愛理 | 順天堂大学 | 9:12.45 | +6.16 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 4 | 相場 茉奈 | 大東文化大学 | 9:18.49 | +12.20 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 5 | 森 彩純 | 大東文化大学 | 9:21.00 | +14.71 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 6 | 田中 那奈 | しまむら | 9:24.84 | +18.55 | ホクレン・ディスタンスチャレンジ2025 第5戦 網走会場 |
| 7 | 山﨑 空 | ベアーズ | 9:26.77 | +20.48 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 8 | 田中 希実 | 日本体育大学 | 9:27.44 | +21.15 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 9 | 勝 くるみ | 筑波大学 | 9:28.25 | +21.96 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 10 | 多田 妃奈 | 肥後銀行 | 9:32.05 | +25.76 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
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| 11 | 平尾 暁絵 | 大東文化大学 | 9:32.94 | +26.65 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 12 | 對馬 千紘 | スターツ | 9:34.31 | +28.02 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 13 | 久保 心優 | 肥後銀行 | 9:38.28 | +31.99 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 14 | 河人 美貴 | 鹿屋体育大学 | 9:38.61 | +32.32 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 15 | 酒井 千菜 | 順天堂大学 | 9:39.39 | +33.10 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 16 | 南 日向 | 中央大学 | 9:39.57 | +33.28 | 日体大女子長距離競技会 |
| 17 | 石正 彩綾 | 東京農業大学 | 9:40.71 | +34.42 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 18 | 飯塚 菜月 | ダイソー | 9:43.55 | +37.26 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 19 | 黒田 愛梨 | シスメックス | 9:45.66 | +39.37 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 20 | 坂本 奈穂 | ベアーズ | 9:45.79 | +39.50 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 21 | 堀田 佳奈 | 鹿児島銀行 | 9:48.87 | +42.58 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 22 | 高江 友姫 | 肥後銀行 | 9:50.77 | +44.48 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 23 | 高橋 知広 | 順天堂大学 | 9:52.24 | +45.95 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 24 | 佐藤 悠花 | 日本体育大学 | 9:52.31 | +46.02 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 25 | 道田 衣舞 | 東京女子体育大学 | 9:52.66 | +46.37 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 26 | 鈴木 和香奈 | 東京農業大学 | 9:52.85 | +46.56 | 日体大女子長距離競技会 |
| 27 | 蓬田 梨世蘭 | 白鴎大学 | 9:57.61 | +51.32 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 28 | 宮川 紗耶 | デンソー | 9:58.69 | +52.40 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 29 | 豊田 茉央 | 法政大学 | 10:02.32 | +56.03 | 日体大女子長距離競技会 |
| 30 | 前田 七海 | 中央大学 | 10:04.10 | +57.81 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 31 | 山下 瑞月 | ワコール | 10:05.77 | +59.48 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 32 | 熊谷 叶香 | 日本女子体育大学 | 10:07.98 | +1:01.69 | 日体大女子長距離競技会 |
| 33 | 和田 水希 | 松戸市陸協 | 10:09.57 | +1:03.28 | 日体大女子長距離競技会 |
| 34 | 仲西 梨花 | 中央大学 | 10:10.43 | +1:04.14 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 35 | 西澤 茉鈴 | ダイハツ | 10:15.31 | +1:09.02 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 36 | 山本 結子 | 駿河台大学 | 10:21.56 | +1:15.27 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 37 | 福原 陽 | 新潟医療福祉大学 | 10:24.33 | +1:18.04 | 日体大女子長距離競技会 |
| 38 | 蓬田 梨世蘭 | 白鷗大学 | 10:32.45 | +1:26.16 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 39 | 栁 沙織 | 東京大学 | 10:39.51 | +1:33.22 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 40 | 木野下 奈々 | 松蔭大学 | 10:54.14 | +1:47.85 | 日体大女子長距離競技会 |
| 41 | 武藤 由依 | 中京学院大学 | 11:03.90 | +1:57.61 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |