| 1 | ジャネット ジェプコエチ高3 | 倉敷高 | 15:00.92 | | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 2 | 吉田 彩心高3 | 札幌創成高校 | 15:27.79 | +26.87 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 3 | 瀬戸口 凜高2 | 神村学園高校 | 15:47.37 | +46.45 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 4 | 野口 紗喜音高3 | 神村学園高校 | 15:56.50 | +55.58 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 5 | ムティダ キャサリン高2 | 山梨学院高校 | 16:00.80 | +59.88 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 6 | 木田 美緒莉高3 | 旭川龍谷高校 | 16:05.96 | +1:05.04 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 7 | 大川 菜々美高3 | 和歌山北高校 | 16:06.10 | +1:05.18 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 8 | シュブルチェック アンナ高2 | 牛久高校 | 16:13.13 | +1:12.21 | 日体大女子長距離競技会 |
| 9 | 前田 二千翔高3 | 三浦学苑高校 | 16:16.76 | +1:15.84 | 日体大女子長距離競技会 |
| 10 | 福山 若奈高3 | 埼玉栄高校 | 16:22.37 | +1:21.45 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
|
| 11 | 渡邉 理早子高3 | 佐倉高校 | 16:28.13 | +1:27.21 | 日体大女子長距離競技会 |
| 12 | 細見 芽生 | 名城大学 | 16:28.53 | +1:27.61 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 13 | 大崎 美希高1 | 山梨学院高校 | 16:32.76 | +1:31.84 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 14 | 鈴木 かのん | 仙台育英 | 16:33.51 | +1:32.59 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 15 | 田畑 陽菜高3 | 長野東高校 | 16:35.14 | +1:34.22 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 16 | 坂元 唯花高3 | 山梨学院高校 | 16:36.06 | +1:35.14 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 17 | 若林 藍那 | 亜細亜大学 | 16:37.39 | +1:36.47 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 18 | 稲井 円花高2 | 共愛学園高校 | 16:38.84 | +1:37.92 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 19 | 今井 玲那高2 | 長野東高校 | 16:39.22 | +1:38.30 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 20 | 松浦 銘玉高2 | 埼玉栄高校 | 16:40.28 | +1:39.36 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 21 | 宮崎 彩湖 | 順天堂大学 | 16:41.87 | +1:40.95 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 22 | 立花 來星々 | しまむら | 16:42.34 | +1:41.42 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 23 | 大木 心夏高3 | 明星高校 | 16:44.16 | +1:43.24 | 日体大女子長距離競技会 |
| 24 | 森高 榎梨高2 | 城西大城西高校 | 16:44.79 | +1:43.87 | 日体大女子長距離競技会 |
| 25 | 鴨狩 侑芽高1 | 錦城学園高校 | 16:45.10 | +1:44.18 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 26 | 小川 真生高3 | 稲生高校 | 16:48.98 | +1:48.06 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 27 | 岡﨑 芽依 | 筑波大学 | 16:51.39 | +1:50.47 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 28 | 前田 百花 | 駿河台大学 | 16:52.37 | +1:51.45 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 29 | 菅原 雛星高1 | 埼玉栄高校 | 16:52.84 | +1:51.92 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 30 | 岡本 彩希 | 名城大学 | 16:54.39 | +1:53.47 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 31 | 山本 心愛高2 | 西脇工業高 | 16:57.01 | +1:56.09 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 32 | 永井 そら高2 | 埼玉栄高校 | 17:02.62 | +2:01.70 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 33 | 立山 美月高2 | 花巻東高校 | 17:03.06 | +2:02.14 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 34 | 綱川 まい | 東京農業大学 | 17:08.30 | +2:07.38 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 35 | 栗原 未羽高2 | 共愛学園高校 | 17:14.25 | +2:13.33 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 36 | 竹村 ありさ高3 | 三浦学苑高校 | 17:22.81 | +2:21.89 | 日体大女子長距離競技会 |
| 37 | 神奈川 心菜 | 亜細亜大学 | 17:28.63 | +2:27.71 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 38 | 大浦 陽奈乃高3 | 仙台育英高校 | 17:36.94 | +2:36.02 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 39 | 矢ノ目 千桜 | 白大学 | 17:52.17 | +2:51.25 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 40 | 杉本 彩香 | 駿河台大学 | 17:57.16 | +2:56.24 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 41 | 稲村 佳奈子 | 新潟医療福祉大学 | 17:57.19 | +2:56.27 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 42 | 矢ノ目 千桜 | 白鴎大学 | 17:58.69 | +2:57.77 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 43 | 矢ノ目 千桜 | 白鷗大学 | 18:02.51 | +3:01.59 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 44 | 新明 樹里花高3 | 市立柏高校 | 18:07.24 | +3:06.32 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |