| 1 | 落合 晃 | - | 3:44.18 | | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 2 | ブライアン キプトー | コモディイイダ | 3:44.33 | +0.15 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 3 | 田村 亘之介 | 城西大学 | 3:46.08 | +1.90 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 4 | 水野 颯也 | 立命館大学 | 3:46.61 | +2.43 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 5 | 椙山 一颯 | 青山学院大学 | 3:47.96 | +3.78 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 6 | 小澤 優翔 | 城西大学 | 3:48.66 | +4.48 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 7 | 荻原 太陽 | 東海大学 | 3:48.95 | +4.77 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 8 | 立石 晟唯 | 東京国際大学 | 3:50.21 | +6.03 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 9 | 牛嶋 勇人 | 神奈川大学 | 3:51.20 | +7.02 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 10 | 大橋 史空 | 札幌学院大学 | 3:51.48 | +7.30 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
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| 11 | 中島 颯太 | 城西大学 | 3:52.54 | +8.36 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 12 | 川村 駿斗 | 千葉大学 | 3:53.09 | +8.91 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 13 | 森尻 悠翔 | 芝浦工業大学 | 3:56.07 | +11.89 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 14 | 岩瀬 駿介 | 芝浦工業大学 | 3:56.44 | +12.26 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 15 | 島田 裕豊 | 武蔵野学院大学 | 3:56.87 | +12.69 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 16 | 柳井 快音 | 清和大学 | 3:56.90 | +12.72 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 17 | 村澤 大雅 | 専修大学 | 3:56.95 | +12.77 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 18 | 北島 典幸 | 筑波大学 | 3:58.05 | +13.87 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 19 | 安藤 佑馬 | 日本体育大学 | 3:58.25 | +14.07 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 20 | 関 朝陽 | 大東文化大学 | 3:58.38 | +14.20 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 21 | 後藤 秀波 | 芝浦工業大学 | 3:59.25 | +15.07 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 22 | 渡邉 直登 | 神奈川大学 | 4:00.62 | +16.44 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 23 | 豊田 諒月 | 神奈川大学 | 4:01.67 | +17.49 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 24 | 村橋 郁斗 | 神奈川大学 | 4:02.44 | +18.26 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 25 | キプゲノ ケネス | 札幌学院大学 | 4:03.03 | +18.85 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 26 | 牛嶋 勇斗 | 神奈川大学 | 4:03.64 | +19.46 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 27 | 山川 真裕 | 東京陸協 | 4:04.16 | +19.98 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 28 | 橋本 龍征 | 明治学院大学 | 4:04.33 | +20.15 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 29 | 岩田 和大 | 科学大院 | 4:04.64 | +20.46 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 30 | 藤田 陸登 | 明治学院大学 | 4:05.99 | +21.81 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 31 | 相川 朔也 | 立正大学 | 4:06.51 | +22.33 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 32 | 末吉 琉衣 | 日本体育大学 | 4:06.84 | +22.66 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 33 | 古川 慶稀 | 駿河台大学 | 4:07.93 | +23.75 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 34 | 和多 希巳 | 立正大学 | 4:08.46 | +24.28 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 35 | 峰尾 遼 | 神奈川大学 | 4:11.30 | +27.12 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 36 | 森 響輝 | 立正大学 | 4:11.68 | +27.50 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 37 | 小林 隼 | 武蔵野学院大学 | 4:11.96 | +27.78 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 38 | 鈴木 豊 | 神奈川陸協 | 4:13.03 | +28.85 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 39 | 荒井 怜生 | 千葉大学 | 4:13.75 | +29.57 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 40 | 清水 康寿 | 日本体育大学 | 4:16.85 | +32.67 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 41 | 大川 功貴 | 立正大学 | 4:22.88 | +38.70 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |