| 1 | 大場 崇義 | 城西大学 | 3:46.68 | | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 2 | 大門 晃士 | 早大同 | 3:47.03 | +0.35 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 3 | 橋本 健市 | 城西大学 | 3:48.22 | +1.54 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 4 | 齋藤 一筋 | 創価大学 | 3:48.70 | +2.02 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 5 | 関野 大空 | 明治学院大学 | 3:49.99 | +3.31 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 6 | 平野 音郁 | 亜細亜大学 | 3:51.60 | +4.92 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 7 | 成沢 翔英 | 慶應義塾大学 | 3:51.77 | +5.09 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 8 | 小野 太廊 | 日本体育大学 | 3:53.48 | +6.80 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 9 | 野間 黎矢 | 神奈川大学 | 3:53.50 | +6.82 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 10 | 花井 日友雅 | 帝京大学 | 3:53.92 | +7.24 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
|
| 11 | 成田 太陽 | 拓殖大学 | 3:54.60 | +7.92 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 12 | 湧川 辰哉 | 関東学院大学 | 3:56.17 | +9.49 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 13 | 庄司 孔 | 東京国際大学 | 3:57.41 | +10.73 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 14 | 吉岡 龍一 | 千葉陸協 | 3:57.64 | +10.96 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 15 | 岩崎 輝翔 | 帝京大学 | 3:58.33 | +11.65 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 16 | 遠藤 煌斗 | 日本体育大学 | 3:58.39 | +11.71 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 17 | 金森 晴音 | 立命館大学 | 3:59.10 | +12.42 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 18 | 森 陸飛 | 帝京大学 | 4:00.05 | +13.37 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 19 | 間 翔太 | 立教大学 | 4:01.65 | +14.97 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 20 | 井口 愁斗 | 東京国際大学 | 4:01.76 | +15.08 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 21 | 小黒 慧 | 日本体育大学 | 4:03.22 | +16.54 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 22 | 山田 望仁 | 東京大学 | 4:03.31 | +16.63 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 23 | 横内 駿 | 札幌学院大学 | 4:06.54 | +19.86 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 24 | 森田 歩充 | 帝京大学 | 4:09.02 | +22.34 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 25 | 砂川 大和 | 帝京大学 | 4:12.60 | +25.92 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 26 | 杉山 翔梧 | 湘南工科大学 | 4:16.56 | +29.88 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 27 | 鈴木 朝陽 | 東北大学 | 4:17.61 | +30.93 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 28 | 和佐田 拓海 | 育英大学 | 4:18.55 | +31.87 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 29 | 藤 陽由 | 玉川大学 | 4:30.43 | +43.75 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 30 | 橋詰 史歩 | 駿河台大学 | 4:34.09 | +47.41 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 31 | 始関 千華 | 早稲田大学 | 4:36.10 | +49.42 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 32 | 宮内 結愛 | 第一生命グループ | 4:36.88 | +50.20 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 33 | 益塚 稀 | 東京農業大学 | 4:36.98 | +50.30 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 34 | 岡本 可蓮 | 東洋大学 | 4:39.19 | +52.51 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 35 | 堀越 なつこ | 東京農業大学 | 4:41.14 | +54.46 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 36 | 瀬戸 悠理 | 拓殖大学 | 4:42.14 | +55.46 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 37 | 杉本 桃香 | 埼玉医科大学G | 4:43.01 | +56.33 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 38 | 武田 亜子 | 早稲田大学 | 4:46.09 | +59.41 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 39 | 須山 沙奈 | 東京農業大学 | 4:50.28 | +1:03.60 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 40 | 巽 映里香 | 国際武道大学 | 5:03.97 | +1:17.29 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 41 | 二色 悠楽 | 日本女子体育大学 | 5:08.05 | +1:21.37 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 42 | 保坂 萌 | 拓殖大学 | 5:09.80 | +1:23.12 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 43 | 小嶋 聖來 | 拓殖大学 | 5:12.94 | +1:26.26 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 44 | 椎名 渚 | 法政大学 | 5:13.67 | +1:26.99 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 45 | 中塚 美聡 | 日本女子体育大学 | 5:29.53 | +1:42.85 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
