| 1 | 立迫 大徳 | 早稲田大学 | 3:42.76 | | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 2 | 寺田 向希 | 中央大学 | 3:44.15 | +1.39 | 2025ホクレン・ﾃﾞｨｽﾀﾝｽﾁｬﾚﾝｼﾞin北海道 第4戦 北見大会 |
| 3 | 大場 崇義 | 城西大学 | 3:46.68 | +3.92 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 4 | 馬場 ｱﾝｼﾞｪﾛ光 | 東洋大学 | 3:46.96 | +4.20 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 5 | 井口 愁斗 | 東京国際大学 | 3:46.98 | +4.22 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 6 | 大門 晃士 | 早大同 | 3:47.03 | +4.27 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 7 | 野川 元希 | 明治大学 | 3:47.20 | +4.44 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 8 | 井口 愁斗 | - | 3:47.40 | +4.64 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 9 | 橋本 健市 | 城西大学 | 3:48.22 | +5.46 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 10 | 青木 丈侑 | 三重陸協 | 3:48.40 | +5.64 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
|
| 11 | 齋藤 一筋 | 創価大学 | 3:48.70 | +5.94 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 12 | 大門 晃士 | 早稲田大学 | 3:48.75 | +5.99 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 13 | 八巻 琉伊 | 国士舘大学 | 3:48.87 | +6.11 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 14 | 中川 拓海 | 順天堂大学 | 3:48.90 | +6.14 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 15 | 久山 大祐 | 関西学院大学 | 3:49.76 | +7.00 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 16 | 梅原 悠良 | - | 3:49.96 | +7.20 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 17 | 関野 大空 | 明治学院大学 | 3:49.99 | +7.23 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 18 | 寺田 向希 | - | 3:50.00 | +7.24 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 19 | 陳内 紫音 | 東洋大学 | 3:50.98 | +8.22 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 20 | 成沢 翔英 | 慶應義塾大学 | 3:51.02 | +8.26 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 21 | 平野 音郁 | 亜細亜大学 | 3:51.60 | +8.84 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 22 | 立迫 大徳 | - | 3:53.14 | +10.38 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 23 | 小野 太廊 | 日本体育大学 | 3:53.48 | +10.72 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 24 | 野間 黎矢 | 神奈川大学 | 3:53.50 | +10.74 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 25 | 花井 日友雅 | 帝京大学 | 3:53.92 | +11.16 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 26 | 成田 太陽 | 拓殖大学 | 3:54.60 | +11.84 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 27 | 秋山 稟央 | 駒澤大学 | 3:55.55 | +12.79 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 28 | 前川 拓斗 | 立教大学 | 3:55.82 | +13.06 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 29 | 湧川 辰哉 | 関東学院大学 | 3:56.17 | +13.41 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 30 | 庄司 孔 | 東京国際大学 | 3:57.41 | +14.65 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 31 | 辻 爽良 | 防衛大 | 3:57.55 | +14.79 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 32 | 吉岡 龍一 | 千葉陸協 | 3:57.64 | +14.88 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 33 | 岩崎 輝翔 | 帝京大学 | 3:58.33 | +15.57 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 34 | 遠藤 煌斗 | 日本体育大学 | 3:58.39 | +15.63 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 35 | 藤本 祐輔 | 東洋大学 | 3:59.15 | +16.39 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 36 | 森 陸飛 | 帝京大学 | 4:00.05 | +17.29 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 37 | 間 翔太 | 立教大学 | 4:01.65 | +18.89 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 38 | 小黒 慧 | 日本体育大学 | 4:03.22 | +20.46 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 38 | 垣内 翼 | 帝京大学 | 4:03.22 | +20.46 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 40 | 山田 望仁 | 東京大学 | 4:03.31 | +20.55 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 41 | 横内 駿 | 札幌学院大学 | 4:06.54 | +23.78 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 42 | 森田 歩充 | 帝京大学 | 4:09.02 | +26.26 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 43 | 青木 博希 | 玉川大学 | 4:09.62 | +26.86 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 44 | 砂川 大和 | 帝京大学 | 4:12.60 | +29.84 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 45 | ジェシンタ ニョカビ | デンソー | 4:13.68 | +30.92 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 46 | 杉山 翔梧 | 湘南工科大学 | 4:16.56 | +33.80 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 47 | 鈴木 朝陽 | 東北大学 | 4:17.61 | +34.85 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 48 | 和佐田 拓海 | 育英大学 | 4:18.55 | +35.79 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 49 | 下森 美咲 | 豊田自動織機 | 4:20.70 | +37.94 | 2025ホクレン・ﾃﾞｨｽﾀﾝｽﾁｬﾚﾝｼﾞin北海道 第4戦 北見大会 |
| 50 | ローズ ワングイ | ダイソー | 4:21.18 | +38.42 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 51 | 中後 心晴 | 第一生命グルー | 4:24.84 | +42.08 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 52 | 鈴木 美海 | 筑波大学 | 4:24.92 | +42.16 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 53 | 田中 柚良 | 筑波大学 | 4:25.97 | +43.21 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 54 | 小林 望迪 | 東北福祉大学 | 4:29.87 | +47.11 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 55 | 藤 陽由 | 玉川大学 | 4:30.43 | +47.67 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 56 | 橋詰 史歩 | 駿河台大学 | 4:34.09 | +51.33 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 57 | 始関 千華 | 早稲田大学 | 4:36.10 | +53.34 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 58 | 宮内 結愛 | 第一生命グループ | 4:36.88 | +54.12 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 59 | 益塚 稀 | 東京農業大学 | 4:36.98 | +54.22 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 60 | 杉村 実優 | 順天堂大学 | 4:37.14 | +54.38 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 61 | 和田 瑞希 | 順天堂大学 | 4:38.10 | +55.34 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 62 | 岡本 可蓮 | 東洋大学 | 4:39.19 | +56.43 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 63 | 蓑毛 愛子 | 大東文化大学 | 4:40.44 | +57.68 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 64 | 堀越 なつこ | 東京農業大学 | 4:41.14 | +58.38 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 65 | 瀬戸 悠理 | 拓殖大学 | 4:42.14 | +59.38 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 66 | 杉本 桃香 | 埼玉医科大学G | 4:43.01 | +1:00.25 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 67 | 武田 亜子 | 早稲田大学 | 4:46.09 | +1:03.33 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 68 | 須山 沙奈 | 東京農業大学 | 4:46.65 | +1:03.89 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 69 | 井上 愛梨 | 立教大学 | 4:46.68 | +1:03.92 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 70 | 小嶋 聖來 | 拓殖大学 | 4:50.38 | +1:07.62 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 71 | 二色 悠楽 | 日女体大学 | 4:54.19 | +1:11.43 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 72 | 保坂 萌 | 拓殖大学 | 4:58.09 | +1:15.33 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 73 | 巽 映里香 | 国際武道大学 | 5:03.97 | +1:21.21 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 74 | 二色 悠楽 | 日本女子体育大学 | 5:08.05 | +1:25.29 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 75 | 椎名 渚 | 法政大学 | 5:13.67 | +1:30.91 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 76 | 中塚 美聡 | 日女体大学 | 5:20.02 | +1:37.26 | 第36回関東学生新人陸上競技選手権大会兼関東学生リレー競技会 |
| 77 | 中塚 美聡 | 日本女子体育大学 | 5:29.53 | +1:46.77 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |