| 1 | 飯澤 千翔 | 住友電工 | 3:39.10 | | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 2 | 寺田 向希大3 | 中央大学 | 3:39.91 | +0.81 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 3 | 近藤 寿樹大1 | 東海大学 | 3:40.07 | +0.97 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 4 | 松枝 博輝 | 富士通 | 3:40.15 | +1.05 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 5 | 矢口 陽太 | 東海大学 | 3:40.46 | +1.36 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 6 | 坂東 悠汰 | 富士通 | 3:40.69 | +1.59 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 7 | 漆畑 徳輝 | トーエネック | 3:41.47 | +2.37 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 8 | 成沢 翔英大3 | 慶應義塾大学 | 3:42.17 | +3.07 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 9 | 川澄 克弥 | 日立 | 3:42.20 | +3.10 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 10 | 井口 愁斗大3 | 東京国際大学 | 3:42.22 | +3.12 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
|
| 11 | 塩尻 和也 | 富士通 | 3:42.26 | +3.16 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 12 | 山田 俊輝 | スズキ | 3:42.44 | +3.34 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 13 | 小林 航央 | 阿見AC | 3:42.47 | +3.37 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 14 | 久山 大祐大3 | 関西学院大学 | 3:42.64 | +3.54 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 15 | 岩下 和史大4 | 早稲田大学 | 3:42.65 | +3.55 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 16 | 大塚 直哉 | ひらまつ病院 | 3:42.71 | +3.61 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 17 | 上野 裕一郎 | ひらまつ病院 | 3:43.08 | +3.98 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 18 | 川口 峻太朗大1 | 順天堂大学 | 3:43.51 | +4.41 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 19 | 平井 璃空大3 | 東海大学 | 3:43.61 | +4.51 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 20 | ガユ サミュエル | 専修大学 | 3:43.73 | +4.63 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 21 | 野口 雄大 | トーエネック | 3:43.90 | +4.80 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 22 | 永本 脩大4 | 東海大学 | 3:43.91 | +4.81 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 23 | 宮本 凪大4 | 城西大学 | 3:44.05 | +4.95 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 24 | 後田 築大4 | 順天堂大学 | 3:44.26 | +5.16 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 25 | 関口 絢太 | SGホールディングス | 3:44.44 | +5.34 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 26 | 森玉 鳳雅大4 | 関西大学 | 3:44.85 | +5.75 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 27 | 片桐貫太 | MORE | 3:44.88 | +5.78 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 28 | 中野純平 | 東海大学 | 3:45.08 | +5.98 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 28 | 立迫 大徳大3 | 早稲田大学 | 3:45.08 | +5.98 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 30 | 大門 晃士 | 早大同 | 3:45.15 | +6.05 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 31 | 八木原 想太大2 | 立教大学 | 3:45.36 | +6.26 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 32 | 西川 千青 | H o n d a | 3:45.38 | +6.28 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 33 | 福田 海未大3 | 城西大学 | 3:45.61 | +6.51 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 34 | 森 亮太大1 | 順天堂大学 | 3:45.71 | +6.61 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 35 | 飯島 陸斗 | 阿見AC | 3:45.78 | +6.68 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 36 | ブライアン キプトー | コモディイイダ | 3:45.98 | +6.88 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 37 | 藤井 奏汰 | 広島経済大学 | 3:46.16 | +7.06 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 38 | 渡邉 優典大4 | 東北大学 | 3:46.32 | +7.22 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 39 | 村上 遵世大1 | 創価大学 | 3:46.39 | +7.29 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 40 | 平林 樹 | 富士通 | 3:46.44 | +7.34 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 41 | 菅原 爽 | 環太平洋大学 | 3:46.52 | +7.42 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 42 | 高坂 光希大4 | 札幌学院大学 | 3:46.58 | +7.48 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 43 | 池間 凛斗大3 | 順天堂大学 | 3:46.65 | +7.55 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 44 | 野川 元希大3 | 明治大学 | 3:47.00 | +7.90 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 45 | 柴田 侑大3 | 城西大学 | 3:47.14 | +8.04 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 46 | 竹石 優大4 | 環太平洋大学 | 3:47.19 | +8.09 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 47 | 松山 唯人大1 | 東海大学 | 3:47.20 | +8.10 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 48 | 鈴木 雄登 | 中央発條 | 3:47.32 | +8.22 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 49 | 小林 航央 | 阿見アスリートクラブ | 3:47.40 | +8.30 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 50 | 大藪 遙斗大1 | 青山学院大学 | 3:47.43 | +8.33 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 51 | 飯塚 達也 | 山陽特殊製鋼 | 3:47.48 | +8.38 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 52 | 中島 弘太 | 埼玉医科大学G | 3:47.52 | +8.42 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 53 | 吉田 僚大4 | 環太平洋大学 | 3:47.57 | +8.47 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 54 | 片桐 貫太 | MORE | 3:47.68 | +8.58 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 55 | 齋藤 一筋大3 | 創価大学 | 3:47.71 | +8.61 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 56 | 丸山 竜也 | 小森コーポレーション | 3:47.72 | +8.62 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 57 | 保芦 摩比呂大1 | 創価大学 | 3:47.77 | +8.67 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 58 | キャロル デェール | 埼玉陸協 | 3:47.79 | +8.69 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 59 | 一宮 颯斗 | 愛媛銀行 | 3:47.83 | +8.73 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 60 | 圓 太喜高3 | 城西大城西高校 | 3:47.84 | +8.74 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 61 | 前川 拓斗大3 | 立教大学 | 3:47.95 | +8.85 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 62 | 松尾 翼 | 中央大学 | 3:47.97 | +8.87 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 63 | 中島 颯太大2 | 城西大学 | 3:47.99 | +8.89 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 64 | 馬場 ｱﾝｼﾞｪﾛ光大3 | 東洋大学 | 3:48.00 | +8.90 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 65 | 森田 佳祐 | SUBARU | 3:48.05 | +8.95 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 66 | 平野 音郁大3 | 亜細亜大学 | 3:48.07 | +8.97 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 67 | ムチリエリウド カヒガ | - | 3:48.09 | +8.99 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 68 | 佐藤 新太大1 | 東京国際大学 | 3:48.24 | +9.14 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 69 | 林 祐一郎大3 | 至学館大学 | 3:48.31 | +9.21 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 70 | 小山 洋生 | 花王 | 3:48.48 | +9.38 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 71 | 内田 涼太大1 | 創価大学 | 3:48.51 | +9.41 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 72 | 山本 悠悟大1 | 國學院大學 | 3:48.64 | +9.54 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 73 | 小林 航 | 阿見アスリートクラブ | 3:48.67 | +9.57 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 74 | 花井 日友雅大3 | 帝京大学 | 3:48.78 | +9.68 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 75 | 鬼塚 翔太 | MABPMaverick | 3:48.79 | +9.69 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 76 | 佐々木 快斗 | 日本体育大学 | 3:48.80 | +9.70 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 77 | 森松 彩夢 | 國學院大學 | 3:48.85 | +9.75 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 78 | 宗野 佑大大2 | 立正大学 | 3:48.88 | +9.78 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 79 | 飯島 陸斗 | 阿見アスリートクラブ | 3:49.01 | +9.91 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 79 | 武田 和馬 | 花王 | 3:49.01 | +9.91 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 81 | 佐々木 哲大2 | 早稲田大学 | 3:49.16 | +10.06 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 82 | 成田 太陽大3 | 拓殖大学 | 3:49.25 | +10.15 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 83 | 菖蒲 敦司 | 花王 | 3:49.30 | +10.20 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 84 | 片山 直人 | 山陽特殊製鋼 | 3:49.36 | +10.26 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 85 | 佐伯 俊徳大2 | 東海大学 | 3:49.37 | +10.27 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 86 | 伊勢村 羚太 | 城西大学 | 3:49.56 | +10.46 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 87 | 畑中 蓮 | 國學院大學 | 3:49.60 | +10.50 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 87 | 田村 幸太大1 | 創価大学 | 3:49.60 | +10.50 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 89 | 中村 桜大高2 | 長野日大高校 | 3:49.82 | +10.72 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 90 | 小野 太廊大3 | 日本体育大学 | 3:50.18 | +11.08 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 91 | 井口 愁斗 | - | 3:50.20 | +11.10 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 92 | 市川 和英大4 | 関東学院大学 | 3:50.40 | +11.30 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 93 | 花城 欄斗 | 日本体育大学 | 3:50.42 | +11.32 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 94 | 藤本 祐輔大3 | 東洋大学 | 3:50.45 | +11.35 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 95 | 黒木 陽向大4 | 創価大学 | 3:50.54 | +11.44 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 96 | 成田 太陽 | - | 3:50.59 | +11.49 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 97 | 増子 風希大3 | 明治大学 | 3:50.71 | +11.61 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 98 | 古屋 颯太高3 | 市立船橋高校 | 3:50.76 | +11.66 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 99 | 吉田 山登大4 | 平成国際大学 | 3:50.81 | +11.71 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 100 | 田中 智稀大2 | 青山学院大学 | 3:51.08 | +11.98 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |