| 1 | 小池 大晴 | 相洋高校 | 3:55.49 | | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 2 | 朝倉 悠羽 | 山梨学院高校 | 3:56.71 | +1.22 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 3 | 鈴木 朝陽 | 青森山田高校 | 3:57.24 | +1.75 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 4 | 角舘 歩樹 | 城西大城西高校 | 4:02.11 | +6.62 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 5 | 成田 光希 | 相洋高校 | 4:02.13 | +6.64 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 6 | 山中 朔児 | 城西大城西高校 | 4:02.15 | +6.66 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 7 | 梅木 大輝 | 足立新田高校 | 4:04.70 | +9.21 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 8 | 臼井 礼翔 | 武蔵越生高校 | 4:04.74 | +9.25 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 9 | 中岫 奏輔 | 青森山田高校 | 4:05.41 | +9.92 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 10 | 坂下 漣 | 青森山田高校 | 4:06.02 | +10.53 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
|
| 11 | 菊池 大夢 | 青森山田高校 | 4:06.44 | +10.95 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 12 | 石塚 煌人 | 東京農大三高校 | 4:07.11 | +11.62 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 13 | 永井 琉惺 | 城西大城西高校 | 4:07.17 | +11.68 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 14 | 柴田 悠真 | 相洋高校 | 4:07.58 | +12.09 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 15 | 櫻井 信吾 | 城北高校 | 4:07.93 | +12.44 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 16 | 南川 雄界 | 城西大城西高校 | 4:08.05 | +12.56 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 17 | 後藤 大晴 | 相洋高校 | 4:08.13 | +12.64 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 18 | 清藤 優成 | 城西大城西高校 | 4:08.16 | +12.67 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 19 | 丸山 遙輝 | 城西大城西高校 | 4:08.48 | +12.99 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 20 | 佐々木 凉蒼 | 青森山田高校 | 4:09.73 | +14.24 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 21 | 鳥谷部 凌央 | 青森山田高校 | 4:11.18 | +15.69 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 22 | 中村 舜大 | 長野日大高校 | 4:11.55 | +16.06 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 23 | 久保田 莉央 | 武蔵越生高校 | 4:12.32 | +16.83 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 24 | 山本 穂高 | 城西大城西高校 | 4:14.29 | +18.80 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 25 | 伊藤 翔貴 | 城西大城西高校 | 4:14.60 | +19.11 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 26 | 駒澤 直弥 | 相洋高校 | 4:15.82 | +20.33 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 27 | 田嶋 禮貴歩 | 青森山田高校 | 4:16.20 | +20.71 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 28 | 石原 万結 | 仙台育英高校 | 4:21.07 | +25.58 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 29 | 長森 結愛 | 仙台育英高校 | 4:21.38 | +25.89 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 30 | 黒川 志帆 | 仙台育英高校 | 4:22.70 | +27.21 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 31 | 大木 陽輝 | 相洋高校 | 4:24.02 | +28.53 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 32 | 永瀬 楓真 | 相洋高校 | 4:26.28 | +30.79 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 33 | 藤澤 心々 | 共愛学園高校 | 4:31.21 | +35.72 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 34 | 田口 心愛 | 城西大城西高校 | 4:34.20 | +38.71 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 35 | 近藤 楓香 | 東大阪大敬愛高校 | 4:34.23 | +38.74 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 36 | 菅原 雛星 | 埼玉栄高校 | 4:35.52 | +40.03 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 37 | 大継 詩乃 | 大阪薫英女学院高校 | 4:35.85 | +40.36 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 38 | 研屋 杏虹 | 稲生高校 | 4:42.03 | +46.54 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 39 | 隅田 美月 | 豊川高校 | 4:43.80 | +48.31 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 40 | 山本 留衣 | 東大阪大敬愛高校 | 4:44.90 | +49.41 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 41 | 櫛渕 光愛 | 白鵬女子高校 | 4:45.31 | +49.82 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 42 | 新井 璃桜 | 市立橘高校 | 4:45.43 | +49.94 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 43 | 鴨狩 侑奈 | 錦城学園高校 | 4:49.01 | +53.52 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 44 | 橘山 瑠南 | 山梨学院高校 | 4:54.91 | +59.42 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 45 | 北村 和奏 | 埼玉栄高校 | 4:56.32 | +1:00.83 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 46 | 上野 愛夏 | 城西大城西高校 | 4:56.47 | +1:00.98 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 47 | 鳴海 詩音 | 旭川龍谷高校 | 4:57.15 | +1:01.66 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 48 | 長岩 来維 | 白鵬女子高校 | 4:59.76 | +1:04.27 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 49 | 長谷川 埜恵 | 城西大城西高校 | 5:01.29 | +1:05.80 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 50 | 時貞 未来 | 荏田高校 | 5:02.22 | +1:06.73 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 51 | 山口 茉優 | 埼玉栄高校 | 5:05.43 | +1:09.94 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 52 | 秋元 玲 | 盛岡誠桜高校 | 5:08.21 | +1:12.72 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 53 | 廣田 みちる | 城西大城西高校 | 5:10.20 | +1:14.71 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 54 | 加藤 いつき | 荏田高校 | 5:17.69 | +1:22.20 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 55 | 米田 莉奈 | 荏田高校 | 5:25.81 | +1:30.32 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
