| 1 | 寺田 向希大3 | 中央大学 | 3:39.91 | | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 2 | 近藤 寿樹大1 | 東海大学 | 3:40.07 | +0.16 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 3 | 成沢 翔英大3 | 慶應義塾大学 | 3:42.17 | +2.26 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 4 | 井口 愁斗大3 | 東京国際大学 | 3:42.22 | +2.31 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 5 | 久山 大祐大3 | 関西学院大学 | 3:42.64 | +2.73 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 6 | 岩下 和史大4 | 早稲田大学 | 3:42.65 | +2.74 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 7 | 大塚 直哉 | ひらまつ病院 | 3:42.71 | +2.80 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 8 | 川口 峻太朗大1 | 順天堂大学 | 3:43.51 | +3.60 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 9 | 平井 璃空大3 | 東海大学 | 3:43.61 | +3.70 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 10 | 永本 脩大4 | 東海大学 | 3:43.91 | +4.00 | 第250回東海大学長距離競技会 |
|
| 11 | 宮本 凪大4 | 城西大学 | 3:44.05 | +4.14 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 12 | 後田 築大4 | 順天堂大学 | 3:44.26 | +4.35 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 13 | 森玉 鳳雅大4 | 関西大学 | 3:44.85 | +4.94 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 14 | 立迫 大徳大3 | 早稲田大学 | 3:45.08 | +5.17 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 15 | 大門 晃士 | 早大同 | 3:45.15 | +5.24 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 16 | 八木原 想太大2 | 立教大学 | 3:45.36 | +5.45 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 17 | 福田 海未大3 | 城西大学 | 3:45.61 | +5.70 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 18 | 森 亮太大1 | 順天堂大学 | 3:45.71 | +5.80 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 19 | ブライアン キプトー | コモディイイダ | 3:45.98 | +6.07 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 20 | 渡邉 優典大4 | 東北大学 | 3:46.32 | +6.41 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 21 | 村上 遵世大1 | 創価大学 | 3:46.39 | +6.48 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 22 | 高坂 光希大4 | 札幌学院大学 | 3:46.58 | +6.67 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 23 | 池間 凛斗大3 | 順天堂大学 | 3:46.65 | +6.74 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 24 | 野川 元希大3 | 明治大学 | 3:47.00 | +7.09 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 25 | 柴田 侑大3 | 城西大学 | 3:47.14 | +7.23 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 26 | 竹石 優大4 | 環太平洋大学 | 3:47.19 | +7.28 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 27 | 松山 唯人大1 | 東海大学 | 3:47.20 | +7.29 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 28 | 大藪 遙斗大1 | 青山学院大学 | 3:47.43 | +7.52 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 29 | 吉田 僚大4 | 環太平洋大学 | 3:47.57 | +7.66 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 30 | 片桐 貫太 | MORE | 3:47.68 | +7.77 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 31 | 齋藤 一筋大3 | 創価大学 | 3:47.71 | +7.80 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 32 | 保芦 摩比呂大1 | 創価大学 | 3:47.77 | +7.86 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 33 | 前川 拓斗大3 | 立教大学 | 3:47.95 | +8.04 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 34 | 中島 颯太大2 | 城西大学 | 3:47.99 | +8.08 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 35 | 馬場 ｱﾝｼﾞｪﾛ光大3 | 東洋大学 | 3:48.00 | +8.09 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 36 | 平野 音郁大3 | 亜細亜大学 | 3:48.07 | +8.16 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 37 | ムチリエリウド カヒガ | - | 3:48.09 | +8.18 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 38 | 佐藤 新太大1 | 東京国際大学 | 3:48.24 | +8.33 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 39 | 林 祐一郎大3 | 至学館大学 | 3:48.31 | +8.40 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 40 | 内田 涼太大1 | 創価大学 | 3:48.51 | +8.60 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 41 | 山本 悠悟大1 | 國學院大學 | 3:48.64 | +8.73 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 42 | 花井 日友雅大3 | 帝京大学 | 3:48.78 | +8.87 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 43 | 宗野 佑大大2 | 立正大学 | 3:48.88 | +8.97 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 44 | 佐々木 哲大2 | 早稲田大学 | 3:49.16 | +9.25 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 45 | 成田 太陽大3 | 拓殖大学 | 3:49.25 | +9.34 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 46 | 佐伯 俊徳大2 | 東海大学 | 3:49.37 | +9.46 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 47 | 田村 幸太大1 | 創価大学 | 3:49.60 | +9.69 | 2026日本学生陸上競技個人選手権大会 |
| 48 | 小野 太廊大3 | 日本体育大学 | 3:50.18 | +10.27 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 49 | 井口 愁斗 | - | 3:50.20 | +10.29 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 50 | 市川 和英大4 | 関東学院大学 | 3:50.40 | +10.49 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 51 | 藤本 祐輔大3 | 東洋大学 | 3:50.45 | +10.54 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 52 | 黒木 陽向大4 | 創価大学 | 3:50.54 | +10.63 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 53 | 成田 太陽 | - | 3:50.59 | +10.68 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 54 | 増子 風希大3 | 明治大学 | 3:50.71 | +10.80 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 55 | 吉田 山登大4 | 平成国際大学 | 3:50.81 | +10.90 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 56 | 田中 智稀大2 | 青山学院大学 | 3:51.08 | +11.17 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 57 | 関 朝陽大2 | 大東文化大学 | 3:51.19 | +11.28 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 58 | 八巻 琉伊大3 | 国士舘大学 | 3:51.21 | +11.30 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 59 | 島田 裕豊大2 | 武蔵野学院大学 | 3:51.41 | +11.50 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 60 | 小林 環大1 | 明治大学 | 3:51.43 | +11.52 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 61 | 関野 大空大3 | 明治学院大学 | 3:51.50 | +11.59 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 62 | 小野 真忠大3 | 東海大学 | 3:51.52 | +11.61 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 63 | 五十嵐 新太大1 | 國學院大學 | 3:51.62 | +11.71 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 64 | 野尻 七星大3 | 創価大学 | 3:51.71 | +11.80 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 65 | 宮本 錬大3 | 清和大学 | 3:51.80 | +11.89 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 66 | 大原 快斗大2 | 環太平洋大学 | 3:51.86 | +11.95 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 67 | 松岡 空良大2 | 城西大学 | 3:51.93 | +12.02 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 68 | 牛嶋 勇斗大2 | 神奈川大学 | 3:51.97 | +12.06 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 69 | 藤田 圭悟大2 | 創価大学 | 3:52.05 | +12.14 | 第250回東海大学長距離競技会 |
| 70 | 荻原 太陽大2 | 東海大学 | 3:52.15 | +12.24 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 71 | 松下 俊海大3 | 環太平洋大学 | 3:52.32 | +12.41 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 72 | 山田 直希大3 | 東海大学 | 3:52.38 | +12.47 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 73 | 檜垣 蒼大2 | 東海大学 | 3:52.51 | +12.60 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 74 | 葛城 渚大3 | 城西大学 | 3:52.52 | +12.61 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 75 | 松尾 悠登 | - | 3:52.66 | +12.75 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 76 | 太田 仁大2 | 山梨学院大学 | 3:53.04 | +13.13 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 77 | 山崎 寿和大1 | 神奈川大学 | 3:53.21 | +13.30 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 78 | 丸山 堪大大1 | 城西国際大学 | 3:53.27 | +13.36 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 79 | 松永 拓己大2 | 立教大学 | 3:53.44 | +13.53 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 80 | 松瀬 優慎大3 | 長崎国際大学 | 3:53.52 | +13.61 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 81 | 大関 星斗大1 | 芝浦工業大学 | 3:53.59 | +13.68 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 82 | 松尾 悠登大4 | 東京国際大学 | 3:53.74 | +13.83 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 83 | 大橋 正昊大3 | 駿河台大学 | 3:53.78 | +13.87 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 84 | 小堺 隆弘大4 | 一橋大学 | 3:53.79 | +13.88 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 85 | 丹野 暁翔大4 | 芝浦工業大学 | 3:53.97 | +14.06 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 86 | 白岩 敬吾大1 | 山梨学院大学 | 3:54.00 | +14.09 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 87 | 村澤 大雅大2 | 専修大学 | 3:54.14 | +14.23 | 第327回日本体育大学長距離競技会 兼 第20回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 87 | 落合 智優大1 | 帝京大学 | 3:54.14 | +14.23 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 89 | 三井 悠暉大4 | 明治大学陸上競技同好会 | 3:54.17 | +14.26 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 89 | 東泉 大河 | 小森コーポレーション | 3:54.17 | +14.26 | 日本体育大学長距離競技会 |
| 91 | 嶋田 啓希大4 | 順天堂大学 | 3:54.28 | +14.37 | 第330回日本体育大学長距離競技会 兼 第23回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 91 | 杉原 立樹大3 | 上武大学 | 3:54.28 | +14.37 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 93 | 矢島 旬大1 | 桜美林大学 | 3:54.33 | +14.42 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 94 | 池田 琢真大1 | 武蔵野学院大学 | 3:54.49 | +14.58 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 95 | 髙橋 功平大1 | 神奈川大学 | 3:54.52 | +14.61 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 96 | 石田 優大1 | 山梨学院大学 | 3:54.57 | +14.66 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
| 97 | 福嶋 明大大4 | 信州大学 | 3:54.67 | +14.76 | 第245回東海大学長距離競技会 |
| 98 | 遠藤 煌斗大3 | 日本体育大学 | 3:54.77 | +14.86 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 98 | 山崎 碧葉大1 | 神奈川大学 | 3:54.77 | +14.86 | 第247回東海大学長距離競技会 |
| 100 | 村橋 郁斗大2 | 神奈川大学 | 3:55.06 | +15.15 | 第328回日本体育大学長距離競技会 兼 第21回 NITTAIDAI Challenge Games |
