| 1 | ジャネット ジェプコエチ高3 | 倉敷高 | 8:48.23 | | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 2 | アカイ メアリー高2 | 白鵬女高 | 8:55.02 | +6.79 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 3 | 芦田 和佳 | 立命館宇治 | 8:59.45 | +11.22 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 4 | 池野 絵莉高3 | 須磨学園高校 | 9:04.38 | +16.15 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 5 | 男乕 結衣 | 東北 | 9:07.16 | +18.93 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 6 | 川上 南海高2 | 長野東高校 | 9:08.08 | +19.85 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 7 | 吉田 彩心高3 | 札幌創成高校 | 9:09.26 | +21.03 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 8 | 瀬戸口 凜 | 神村学園 | 9:14.77 | +26.54 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 9 | 南條 愛歩高3 | 倉敷高 | 9:15.37 | +27.14 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 10 | シュブルチェック アンナ高2 | 牛久高校 | 9:15.60 | +27.37 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
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| 11 | 宇都宮 桃奈高2 | 札幌山の手高校 | 9:22.69 | +34.46 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 12 | 長谷川 結都高2 | 東大阪大敬愛高校 | 9:22.88 | +34.65 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 前田 二千翔高3 | 三浦学苑高校 | 9:24.18 | +35.95 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 14 | 岩村 莉奈高2 | 銀河学院高校 | 9:24.53 | +36.30 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 15 | 杉森 由萌高3 | 中央中等高 | 9:25.11 | +36.88 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 16 | 松本 瑠莉高3 | 宇都宮文星女高校 | 9:26.36 | +38.13 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 17 | 橘 のん高2 | 仙台育英高校 | 9:26.52 | +38.29 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 18 | 佐々木 玲奈高3 | 筑紫女学園高 | 9:26.66 | +38.43 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 19 | 田畑 陽菜高3 | 長野東高校 | 9:26.71 | +38.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 菅原 心菜 | 小林 | 9:27.05 | +38.82 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 21 | 杤尾 佳穂高3 | 西京高 | 9:27.78 | +39.55 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 22 | 立石 里央菜 | 城東 | 9:29.61 | +41.38 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 23 | 大石 蒼依 | 仙台育英 | 9:29.79 | +41.56 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 24 | 福山 若奈高3 | 埼玉栄高校 | 9:31.22 | +42.99 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 25 | 東 心絆 | 銀河学院 | 9:31.33 | +43.10 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 26 | 松本 紗直 | 旭丘 | 9:31.36 | +43.13 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 27 | 本田 佳穂高1 | 長崎商高 | 9:31.41 | +43.18 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 28 | 石川 桃子 | 新潟明訓 | 9:31.44 | +43.21 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 29 | 湯田 和未高3 | 学法石川高校 | 9:32.83 | +44.60 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 30 | 武田 星莉 | 鹿児島神村学園 | 9:34.24 | +46.01 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 31 | 谷 凪紗 | 豊川 | 9:34.63 | +46.40 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 32 | 大谷 芽以 | 名城大学 | 9:34.69 | +46.46 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 33 | 岡﨑 萌々高3 | 中大附属横浜高校 | 9:35.43 | +47.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 34 | 白石 真子高2 | 筑紫女学園高 | 9:35.45 | +47.22 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 35 | 稲井 円花高2 | 共愛学園高校 | 9:36.19 | +47.96 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 36 | 村松 帆乃美高1 | 東海大相模高校 | 9:36.80 | +48.57 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 37 | 長谷川 采花高3 | 札幌山の手高校 | 9:37.19 | +48.96 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 38 | 大熊 さわ | 福岡大学 | 9:37.43 | +49.20 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 39 | 河合 柚奈高2 | 浜松市立高 | 9:39.44 | +51.21 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 40 | 伊藤 晴香 | 駒澤大学 | 9:41.99 | +53.76 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 41 | 井上 佳奈 | 山形城北 | 9:42.21 | +53.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 42 | 岡村 悠花高1 | 北九州市立高 | 9:42.75 | +54.52 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 43 | 古川 真子高2 | 日大三島高校 | 9:43.12 | +54.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 44 | 松岡 聖奈 | 広島工大 | 9:43.39 | +55.16 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 45 | 吉原 碧彩高3 | 千原台高 | 9:45.12 | +56.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 46 | 上島 円羅高3 | 鯖江高校 | 9:45.97 | +57.74 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 47 | 藤澤 心々高1 | 共愛学園高校 | 9:46.07 | +57.84 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 48 | 渡辺 光桃高3 | 仙台育英高校 | 9:47.00 | +58.77 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 49 | 合田 安伽梨高3 | 旭川龍谷高校 | 9:47.71 | +59.48 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 50 | 越智 愛奈高3 | 今治北高 | 9:48.40 | +1:00.17 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 51 | 穗岐山 実結 | 山田 | 9:50.39 | +1:02.16 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 52 | 中島 絢音高3 | 鹿児島鹿児島高 | 9:52.57 | +1:04.34 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 53 | 御手洗 心菜 | 今治西 | 9:53.15 | +1:04.92 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 54 | 尾﨑 一樺高2 | 智辯カレッジ高 | 9:53.48 | +1:05.25 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 55 | 新谷 恵麻 | 山田 | 9:55.84 | +1:07.61 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 56 | 野村 比奈姫高2 | 西京高 | 9:55.98 | +1:07.75 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 57 | 光岡 琴奈高2 | 白石高 | 9:56.56 | +1:08.33 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 58 | 杉浦 華夏 | 岡崎城西 | 10:00.55 | +1:12.32 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 59 | 大塚 結衣高2 | 鯖江高校 | 10:01.19 | +1:12.96 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 60 | 峯下 優華高3 | 城ノ内中等高 | 10:10.21 | +1:21.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 61 | 小林 桜來高3 | 北海道栄高校 | 10:12.25 | +1:24.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 62 | 松原 こころ高3 | 旭川龍谷高校 | 10:14.85 | +1:26.62 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |