| 1 | ブライアン キプトー | コモディイイダ | 3:44.33 | | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 2 | 小澤 優翔 | 城西大学 | 3:48.66 | +4.33 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 3 | 荻原 太陽 | 東海大学 | 3:48.95 | +4.62 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 4 | 立石 晟唯 | 東京国際大学 | 3:50.82 | +6.49 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 5 | 牛嶋 勇人 | 神奈川大学 | 3:51.20 | +6.87 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 6 | 大橋 史空 | 札幌学院大学 | 3:51.74 | +7.41 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 7 | 中島 颯太 | 城西大学 | 3:52.54 | +8.21 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 8 | 川村 駿斗 | 千葉大学 | 3:53.09 | +8.76 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 9 | 森尻 悠翔 | 芝浦工業大学 | 3:56.07 | +11.74 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 10 | 岩瀬 駿介 | 芝浦工業大学 | 3:56.44 | +12.11 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
|
| 11 | 島田 裕豊 | 武蔵野学院大学 | 3:56.87 | +12.54 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 12 | 柳井 快音 | 清和大学 | 3:56.90 | +12.57 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 13 | 後藤 秀波 | 芝浦工業大学 | 3:59.25 | +14.92 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 14 | 渡邉 直登 | 神奈川大学 | 4:01.99 | +17.66 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 15 | 安藤 佑馬 | 日本体育大学 | 4:02.58 | +18.25 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 16 | 山川 真裕 | 東京陸協 | 4:04.16 | +19.83 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 17 | 相川 朔也 | 立正大学 | 4:06.51 | +22.18 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 18 | 和多 希巳 | 立正大学 | 4:08.46 | +24.13 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 19 | 峰尾 遼 | 神奈川大学 | 4:11.30 | +26.97 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 20 | 森 響輝 | 立正大学 | 4:11.68 | +27.35 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 21 | 小林 隼 | 武蔵野学院大学 | 4:11.96 | +27.63 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 22 | 鈴木 豊 | 神奈川陸協 | 4:13.03 | +28.70 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 23 | 荒井 怜生 | 千葉大学 | 4:13.75 | +29.42 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 24 | 清水 康寿 | 日本体育大学 | 4:16.85 | +32.52 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 25 | 大川 功貴 | 立正大学 | 4:22.88 | +38.55 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 26 | 平方 杏奈 | 東洋大学 | 4:28.93 | +44.60 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 27 | 長田 彩沙 | 亜細亜大学 | 4:30.45 | +46.12 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 28 | 上ノ原 小都理 | 中央大学 | 4:37.71 | +53.38 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 29 | 柿澤 りん | 拓殖大学 | 4:37.97 | +53.64 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 30 | 世古 凪沙 | 城西大学 | 4:38.76 | +54.43 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 31 | 熊倉 花萌 | 早稲田大学 | 4:41.59 | +57.26 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 32 | 小山 和月 | スズキ | 4:41.62 | +57.29 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 33 | 玉城 祐希 | 亜細亜大学 | 4:43.89 | +59.56 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 34 | 西田 未羽 | 玉川大学 | 4:45.30 | +1:00.97 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 35 | 三輪 あかり | 東京女子体育大学 | 4:51.90 | +1:07.57 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 36 | 沖田 真優 | 東洋大学 | 4:54.87 | +1:10.54 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 37 | 紺野 陽菜 | 順天堂大学 | 5:07.28 | +1:22.95 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 38 | 石田 莉子 | 順天堂大学 | 5:16.28 | +1:31.95 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
