| 1 | 齋藤 康太郎 | 東京国際大学 | 8:36.37 | | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 2 | エカラレ マーガレット | 豊田自動織機 | 9:04.37 | +28.00 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 3 | 大西 桃花 | シスメックス | 9:23.93 | +47.56 | 2025ホクレン・ﾃﾞｨｽﾀﾝｽﾁｬﾚﾝｼﾞin北海道 第4戦 北見大会 |
| 4 | 神田 青葉 | ユニクロ | 9:24.66 | +48.29 | ホクレン・ディスタンスチャレンジ２０２５ 第５戦 網走会場 |
| 5 | 岡藤 美音 | 名城大学 | 9:29.52 | +53.15 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 6 | 勝呂 遥香 | パナソニック | 9:33.50 | +57.13 | ホクレン・ディスタンスチャレンジ２０２５ 第５戦 網走会場 |
| 7 | 成瀬 結菜 | 大東文化大学 | 9:33.78 | +57.41 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 8 | 大西 由菜 | 城西大学 | 9:33.99 | +57.62 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 9 | 上柳 凛 | 大東文化大学 | 9:35.46 | +59.09 | 日体大女子長距離競技会 |
| 10 | 磯崎 心音 | 岩谷産業 | 9:36.17 | +59.80 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
|
| 11 | 平泉 心穂 | デンソー | 9:36.94 | +1:00.57 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 12 | 渡邊 百香 | 帝京科学大学 | 9:39.42 | +1:03.05 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 13 | 小山 和月 | スズキ | 9:39.73 | +1:03.36 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 14 | 窪田 舞 | 城西大学 | 9:40.54 | +1:04.17 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 15 | 上 環 | 鹿児島銀行 | 9:40.88 | +1:04.51 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 16 | 栗本 楓花 | 京セラ | 9:41.03 | +1:04.66 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 17 | 鈴木 凜皇 | ニトリ | 9:45.12 | +1:08.75 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 18 | 松平 風花 | デンソー | 9:46.76 | +1:10.39 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 19 | 西田 未羽 | 玉川大学 | 9:47.68 | +1:11.31 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 20 | 鎌田 煌花 | 法政大学 | 9:48.53 | +1:12.16 | 日体大女子長距離競技会 |
| 21 | 親川 杏花 | 名城大学 | 9:49.10 | +1:12.73 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 22 | 戸塚 光梨 | スズキ | 9:49.16 | +1:12.79 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 23 | 冨田 紗帆 | 順天堂大学 | 9:50.03 | +1:13.66 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 24 | 小倉 陽菜 | 豊田自動織機 | 9:51.30 | +1:14.93 | ホクレン・ディスタンスチャレンジ２０２５ 第５戦 網走会場 |
| 25 | 丸山 あおい | 大東文化大学 | 9:51.42 | +1:15.05 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 26 | 新井 えりか | キヤノンアスリートクラブ九州 | 9:53.87 | +1:17.50 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 27 | 菅野 こころ | 拓殖大学 | 9:54.70 | +1:18.33 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 28 | 野田 七海 | センコー | 9:55.04 | +1:18.67 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 29 | 新井 えりか | キャノン | 9:55.46 | +1:19.09 | 日体大女子長距離競技会 |
| 30 | 吉田 あゆ | 京セラ | 9:56.35 | +1:19.98 | 2025ホクレン・ﾃﾞｨｽﾀﾝｽﾁｬﾚﾝｼﾞin北海道 第4戦 北見大会 |
| 31 | 三輪 あかり | 東京女子体育大学 | 10:01.62 | +1:25.25 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 32 | 河野 咲羽 | キヤノンアスリートクラブ九州 | 10:02.03 | +1:25.66 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 33 | 松島 夏希 | 帝京科学大学 | 10:02.14 | +1:25.77 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 34 | 塩谷 優華 | 白鷗大学 | 10:03.38 | +1:27.01 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 35 | 小林 凜花 | 埼玉医科大学G | 10:05.97 | +1:29.60 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 36 | 関口 楓花 | 玉川大学 | 10:07.72 | +1:31.35 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 37 | 山崎 姫由 | 玉川大学 | 10:08.50 | +1:32.13 | 日体大女子長距離競技会 |
| 38 | 山中 千佳 | 亜細亜大学 | 10:08.83 | +1:32.46 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 39 | 馬場園 桃 | キャノン | 10:10.87 | +1:34.50 | 日体大女子長距離競技会 |
| 40 | 菊地 ひな | 白鷗大学 | 10:11.52 | +1:35.15 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 41 | 圓谷 仁渚 | 愛知電機 | 10:11.76 | +1:35.39 | 日体大女子長距離競技会 |
| 42 | 壁谷 衿奈 | ダイソー | 10:11.80 | +1:35.43 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 43 | 河野 咲羽 | キャノン | 10:14.75 | +1:38.38 | 日体大女子長距離競技会 |
| 44 | 横山 美月 | スターツ | 10:18.03 | +1:41.66 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 45 | 河野 和咲 | 新潟医療福祉大学 | 10:18.78 | +1:42.41 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 46 | 竹澤 歩優 | 順天堂大学 | 10:18.83 | +1:42.46 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 47 | 田島 美姫 | 白鴎大学 | 10:19.44 | +1:43.07 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 48 | 梅村 茉那 | 順天堂大学 | 10:21.50 | +1:45.13 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 49 | 香川 穂乃佳 | 駿河台大学 | 10:21.97 | +1:45.60 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 50 | 佐伯 紅南 | 東北大学 | 10:23.18 | +1:46.81 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 51 | 上ノ原 小都理 | 中央大学 | 10:23.52 | +1:47.15 | 日体大女子長距離競技会 |
| 52 | 田島 美姫 | 白鷗大学 | 10:24.42 | +1:48.05 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 53 | 高村 稜花 | 東京農業大学 | 10:27.65 | +1:51.28 | 日体大女子長距離競技会 |
| 54 | 廣瀨 眞希 | 日本体育大学 | 10:28.68 | +1:52.31 | 日体大女子長距離競技会 |
| 55 | 小林 華佳 | 慶應義塾大学 | 10:31.38 | +1:55.01 | 日体大女子長距離競技会 |
| 56 | 永沼 妃織 | 大東文化大学 | 10:36.54 | +2:00.17 | 日体大女子長距離競技会 |
| 57 | 大塚 彩世 | 立教大学 | 10:37.13 | +2:00.76 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 58 | 今井 亜実 | 東京農業大学 | 10:37.42 | +2:01.05 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 59 | 中村 愛花 | 群馬大学 | 10:37.78 | +2:01.41 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 60 | 石田 莉子 | 順天堂大学 | 10:38.90 | +2:02.53 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 61 | 榊原 南 | 玉川大学 | 10:40.94 | +2:04.57 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 62 | 宮崎 真衣 | 白鴎大学 | 10:46.94 | +2:10.57 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 63 | 安藤 咲葵 | センコー | 10:47.90 | +2:11.53 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 64 | 松木 希光 | 白鴎大学 | 10:52.97 | +2:16.60 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 65 | 田邉 風歌 | 白鴎大学 | 10:55.42 | +2:19.05 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 66 | 東 里穂 | 東京女子体育大学 | 10:58.39 | +2:22.02 | 日体大女子長距離競技会 |
| 67 | 原 舞子 | 筑波大学 | 10:59.23 | +2:22.86 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 68 | 野澤 陽菜 | 日本女子体育大学 | 10:59.85 | +2:23.48 | 日体大女子長距離競技会 |
| 69 | 任田 玲実 | 中京学院大学 | 11:04.58 | +2:28.21 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |