| 1 | 竹田 櫂司 | 小林高校 | 8:18.46 | | 第79回国民スポーツ大会 |
| 2 | 長尾 羚煌 | 長崎商高 | 8:23.41 | +4.95 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 3 | 向岩 玖恩 | 敦賀気比高校 | 8:26.10 | +7.64 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 4 | 出田 隆之助中3 | 中京中 | 8:39.22 | +20.76 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 5 | 伊折 駿希 | 東京農大二高校 | 8:39.27 | +20.81 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 6 | 遅澤 友海中3 | 矢板中 | 8:50.85 | +32.39 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 7 | 本庄 瑛太中3 | 竜王中 | 8:55.23 | +36.77 | 第2回陸協記録会 |
| 8 | 福岡 樹 | 有馬 | 8:56.83 | +38.37 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本ｸﾞﾗﾝﾌﾟﾘｼﾘｰｽﾞ 神戸大会 |
| 9 | 田中 郁人中3 | 葉山中 | 8:58.69 | +40.23 | 第2回陸協記録会 |
| 10 | 野本 琉樹哉中3 | 大田原中 | 9:02.11 | +43.65 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
|
| 11 | 勝瀬 琉生 | 彦根翔西館高 | 9:03.56 | +45.10 | 第2回陸協記録会 |
| 12 | 宮田 蒼空 | 学法石川高校 | 9:05.05 | +46.59 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 13 | 赤松 新太 | 四学香川西高 | 9:05.61 | +47.15 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 14 | 塚原 潤季中2 | 真岡長沼中 | 9:11.64 | +53.18 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 15 | 各和 大翔中2 | 烏山中 | 9:12.22 | +53.76 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 16 | 福地 レオ | 足利陸上クラブ | 9:14.35 | +55.89 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 17 | 本山 太智中2 | 唐崎中 | 9:15.57 | +57.11 | 第2回陸協記録会 |
| 18 | 森 颯大中1 | 水口東中 | 9:15.79 | +57.33 | 第2回陸協記録会 |
| 19 | 髙橋 隼人中3 | 新堂中 | 9:18.38 | +59.92 | 第2回陸協記録会 |
| 20 | 大島 歩樹中2 | 瑞穂野中 | 9:21.00 | +1:02.54 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 21 | 小野 蒼太 | F.K.C | 9:21.32 | +1:02.86 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 22 | 奥野 カイア | 大阪薫英女学院高校 | 9:22.46 | +1:04.00 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 23 | 村松 帆乃美 | 東海大相模高校 | 9:25.79 | +1:07.33 | 日体大女子長距離競技会 |
| 24 | 岡部 楓冬中3 | 南犬飼中 | 9:25.94 | +1:07.48 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 25 | 永井 誠翔 | 稲美 | 9:27.40 | +1:08.94 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本ｸﾞﾗﾝﾌﾟﾘｼﾘｰｽﾞ 神戸大会 |
| 26 | 石塚 勇輝中2 | 神吉中 | 9:27.73 | +1:09.27 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本ｸﾞﾗﾝﾌﾟﾘｼﾘｰｽﾞ 神戸大会 |
| 27 | 亀山 晃太郎中2 | 氏家中 | 9:27.80 | +1:09.34 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 28 | 朝日 小都子 | 大阪薫英女学院高校 | 9:27.83 | +1:09.37 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 29 | 米田 倫都中2 | 双葉中 | 9:28.02 | +1:09.56 | 第2回陸協記録会 |
| 30 | 古川 善土中2 | 鬼怒中 | 9:28.80 | +1:10.34 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 31 | 喜田 航生中3 | 栗東西中 | 9:28.95 | +1:10.49 | 第2回陸協記録会 |
| 32 | 篠原 煌祐中3 | 加蘇中 | 9:29.47 | +1:11.01 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 33 | 遠藤 大志中2 | 阿久津中 | 9:29.56 | +1:11.10 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 34 | 佐々木 季咲 | 花巻東高校 | 9:29.69 | +1:11.23 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 35 | 関谷 操馬中2 | 小山城南中 | 9:32.48 | +1:14.02 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 36 | 中村 良碧中3 | 能登川中 | 9:35.50 | +1:17.04 | 第2回陸協記録会 |
| 37 | 柴 泰河中3 | 野洲中 | 9:36.08 | +1:17.62 | 第2回陸協記録会 |
| 38 | 鈴木 陽翔 | 樹徳 | 9:37.66 | +1:19.20 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 39 | 古橋 晃中2 | 間々田中 | 9:38.22 | +1:19.76 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 40 | 亀山 凛 | 佐野高校附中 | 9:38.64 | +1:20.18 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 41 | 山口 朱里 | つるぎ | 9:39.58 | +1:21.12 | 第73回兵庫リレーカーニバル 日本ｸﾞﾗﾝﾌﾟﾘｼﾘｰｽﾞ 神戸大会 |
| 42 | 戸邉 蒼真中2 | 西那須野中 | 9:39.67 | +1:21.21 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 43 | 伊勢村 爽王中3 | 明富中 | 9:40.41 | +1:21.95 | 第2回陸協記録会 |
| 44 | 松尾 優生中2 | 彦根東中 | 9:40.85 | +1:22.39 | 第2回陸協記録会 |
| 45 | 野澤 勇太中2 | 鹿沼東中 | 9:41.07 | +1:22.61 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 46 | 五味 暖翔中3 | 小山中 | 9:42.26 | +1:23.80 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 47 | 菅間 大翔中3 | 真岡東中 | 9:42.39 | +1:23.93 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 48 | 黒木 遊中3 | 烏山中 | 9:42.95 | +1:24.49 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 49 | 中里 樹乃 | 山梨学院高校 | 9:43.67 | +1:25.21 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 50 | 常盤 清人中3 | 若草中 | 9:44.83 | +1:26.37 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 51 | 花田 裕也中3 | 城山中学校 | 9:45.98 | +1:27.52 | 第2回陸協記録会 |
| 52 | 荻原 明優中3 | 泉が丘中 | 9:47.35 | +1:28.89 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 53 | 山田 梓月中3 | 旭中 | 9:48.03 | +1:29.57 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 54 | 日下部 仁美 | 東海大相模高校 | 9:49.09 | +1:30.63 | 日体大女子長距離競技会 |
| 55 | 川口 恋羽 | 秋田北鷹高校 | 9:51.42 | +1:32.96 | 日体大女子長距離競技会 |
| 56 | 秋葉 恭之介中3 | あそ野学園中 | 9:51.51 | +1:33.05 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 57 | 成田 宏成中3 | 間々田中 | 9:52.36 | +1:33.90 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 58 | 青山 未來 | 東海大相模高校 | 9:52.71 | +1:34.25 | 日体大女子長距離競技会 |
| 59 | 田井 瑞季中3 | 大沢中 | 9:52.72 | +1:34.26 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 60 | 石塚 遥翔中3 | 姿川中 | 9:53.55 | +1:35.09 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 61 | 古川 蒼椛 | 豊川高校 | 9:54.07 | +1:35.61 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 62 | 久保 柑奈 | 旭川龍谷高校 | 9:54.73 | +1:36.27 | 日体大女子長距離競技会 |
| 63 | 萩原 一賀中3 | 金田北中学校 | 9:56.29 | +1:37.83 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 64 | 永嶋 伶中3 | 茂木中 | 9:57.85 | +1:39.39 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 65 | 山口 凛華 | 宇都宮文星女子高校 | 9:58.43 | +1:39.97 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 66 | 京極 春人中3 | 守山南中 | 9:59.27 | +1:40.81 | 第2回陸協記録会 |
| 67 | 佐藤 匠 | 愛媛RA | 10:00.03 | +1:41.57 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 68 | 大朏 綜士中2 | 田沼東中 | 10:00.54 | +1:42.08 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 69 | 鮫島 杏花 | 順天高校 | 10:02.23 | +1:43.77 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 70 | 松本 千穂 | 市立橘高校 | 10:02.27 | +1:43.81 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 71 | 熊谷 勇人中2 | 西那須野中 | 10:05.80 | +1:47.34 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 72 | 林 海心中3 | 鹿沼北中 | 10:05.90 | +1:47.44 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 73 | 阿久津 善生中3 | 鹿沼東中 | 10:06.88 | +1:48.42 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 74 | 青山 心中3 | 氏家中 | 10:09.24 | +1:50.78 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 75 | 鳥本 竜佑中2 | 水口中 | 10:09.61 | +1:51.15 | 第2回陸協記録会 |
| 76 | 毛塚 直輝 | NRC | 10:15.02 | +1:56.56 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 77 | 池村 翔太中3 | 水口中 | 10:16.03 | +1:57.57 | 第2回陸協記録会 |
| 78 | 福田 桃愛 | 西脇工業高 | 10:16.61 | +1:58.15 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 79 | 渡邉 一登中2 | 七井中 | 10:16.76 | +1:58.30 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 80 | 加藤 陽真 | 佐野高校附中 | 10:16.88 | +1:58.42 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 81 | 長島 慎太 | 佐野高校附中 | 10:17.17 | +1:58.71 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 82 | 青木 柚奈 | 錦城学園高校 | 10:17.61 | +1:59.15 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 83 | 水野 伶美 | 早稲田実業高校 | 10:17.69 | +1:59.23 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 84 | 市川 心菜 | 木更津総合高校 | 10:18.30 | +1:59.84 | 日体大女子長距離競技会 |
| 85 | 中宗 梨音 | 東大阪大敬愛高校 | 10:20.64 | +2:02.18 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 86 | 廣 七々海 | 荏田高校 | 10:21.85 | +2:03.39 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 87 | 弘山 美輝 | 成田高校 | 10:23.79 | +2:05.33 | 日体大女子長距離競技会 |
| 88 | 前野 椰真斗中2 | 厚崎中 | 10:24.06 | +2:05.60 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 89 | 安藤 理央奈 | 宇都宮文星女子高校 | 10:24.45 | +2:05.99 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 90 | 大西 悠騎中3 | 米原中 | 10:27.36 | +2:08.90 | 第2回陸協記録会 |
| 91 | 望月 梨愛中2 | 今津中 | 10:28.97 | +2:10.51 | 第2回陸協記録会 |
| 92 | 林 咲羽 | 成田高校 | 10:32.82 | +2:14.36 | 日体大女子長距離競技会 |
| 93 | 鈴木 大地中3 | 今市中 | 10:33.74 | +2:15.28 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 94 | 久下 美咲 | 春日部女子高校 | 10:34.50 | +2:16.04 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 95 | 神岡 大牙中3 | 那珂川馬頭中 | 10:35.61 | +2:17.15 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 96 | 岩田 麻里 | 人環大附属岡崎高校 | 10:38.90 | +2:20.44 | 日体大女子長距離競技会 |
| 97 | 安田 昂太朗中2 | 鹿沼東中 | 10:39.51 | +2:21.05 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 98 | 古井戸 苺花 | 新島学園高校 | 10:40.88 | +2:22.42 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 99 | 小口 太都中3 | 芳賀中 | 10:41.03 | +2:22.57 | 第78回栃木県中学校総合体育大会陸上競技大会 |
| 100 | 塩川 澪 | 那須拓陽高校 | 10:41.60 | +2:23.14 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |