| 1 | フェリックス ムティアニ高3 | 山梨学院高校 | 3:39.20 | | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 2 | 河村 一輝 | トーエネック | 3:40.65 | +1.45 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 3 | 新妻 遼己高3 | 西脇工高 | 3:40.83 | +1.63 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 4 | 山本 聖也高3 | 高知農高 | 3:42.05 | +2.85 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 5 | 吉田 星高2 | 東海大札幌高校 | 3:42.27 | +3.07 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 6 | 中村 晃斗大3 | 志學館大 | 3:42.69 | +3.49 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 7 | 漆畑 徳輝 | トーエネック | 3:43.31 | +4.11 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 8 | 川口峻太 朗 | - | 3:43.44 | +4.24 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 9 | 小林 環高3 | 静岡東高校 | 3:43.50 | +4.30 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 10 | 森 亮太高3 | 美濃加茂高校 | 3:43.59 | +4.39 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
|
| 11 | 伊勢村 羚太高3 | 滋賀学園高校 | 3:43.96 | +4.76 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 12 | 黒岩 蘭太朗高3 | 長崎日本大学高 | 3:44.24 | +5.04 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 青木 龍翔大3 | 立教大学 | 3:44.92 | +5.72 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 14 | 簡 子傑 | 仙台育英 | 3:45.26 | +6.06 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 15 | 小河原陽 琉 | 青山学院大学 | 3:45.40 | +6.20 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 16 | 鈴木 太智 | 中京大中京 | 3:45.50 | +6.30 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 17 | 塩原 匠 | - | 3:46.35 | +7.15 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 18 | 近藤 寿樹 | 東海大学 | 3:46.66 | +7.46 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 19 | 梅田 大陸高2 | 須磨学園高校 | 3:46.78 | +7.58 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 今村 仁高3 | 鳥栖工高 | 3:46.85 | +7.65 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 21 | 馬場 ｱﾝｼﾞｪﾛ光大2 | 東洋大学 | 3:46.96 | +7.76 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 22 | 井口 愁斗大2 | 東京国際大学 | 3:46.98 | +7.78 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 23 | 大野 聖登大3 | 順天堂大学 | 3:47.10 | +7.90 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 23 | 大野 聖登 | 順大学連 | 3:47.10 | +7.90 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 25 | 鈴木 太陽 | 慶應義塾大学 | 3:47.17 | +7.97 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 25 | 鈴木 太陽 | 慶大 | 3:47.17 | +7.97 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 27 | 高坂 光希大3 | 札幌学院大学 | 3:47.30 | +8.10 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 28 | 飯干 颯大高2 | 智辯カレッジ高 | 3:47.34 | +8.14 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 29 | 田中 悠大高1 | 洛南高校 | 3:47.61 | +8.41 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 30 | 矢口 陽太 | 東海大学連 | 3:47.66 | +8.46 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 30 | 矢口 陽太 | 東海大学 | 3:47.66 | +8.46 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 32 | 寺田 向希 | 中大 | 3:47.72 | +8.52 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 32 | 寺田 向希大2 | 中央大学 | 3:47.72 | +8.52 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 34 | 椙山 一颯大1 | 青山学院大学 | 3:47.96 | +8.76 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 35 | 後藤 颯星高3 | 酒田南高校 | 3:47.99 | +8.79 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 36 | 田村亘之 介 | 城西大学 | 3:48.09 | +8.89 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 36 | 田村亘之 介 | 城西大学連 | 3:48.09 | +8.89 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 38 | 森松 彩夢 | 一関学院 | 3:48.32 | +9.12 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 39 | 家光 応輔高3 | 美方高校 | 3:48.34 | +9.14 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 40 | 馬場 ｱﾝｼﾞｪﾛ光 | 東洋大学連 | 3:48.44 | +9.24 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 41 | 塩原 匠 | 富士山GX | 3:48.57 | +9.37 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 41 | 塩原 匠 | 順大学連 | 3:48.57 | +9.37 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 43 | 大関 星斗高3 | 土浦日大 | 3:48.58 | +9.38 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 44 | 八巻 琉伊大2 | 国士舘大学 | 3:48.87 | +9.67 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 44 | 八巻 琉伊 | 国士大 | 3:48.87 | +9.67 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 46 | 中川 拓海 | 順大学連 | 3:48.90 | +9.70 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 46 | 中川 拓海大2 | 順天堂大学 | 3:48.90 | +9.70 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 48 | 大場 崇義 | 城西大 | 3:49.04 | +9.84 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 48 | 大場 崇義大2 | 城西大学 | 3:49.04 | +9.84 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 50 | 梅原 悠良 | 東京農業大学 | 3:49.05 | +9.85 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 51 | 田中 純 | 東洋大 | 3:49.06 | +9.86 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 51 | 田中 純大3 | 東洋大学 | 3:49.06 | +9.86 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 53 | 山田 晃央 | - | 3:49.08 | +9.88 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 53 | 山田 晃央 | 早大 | 3:49.08 | +9.88 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 55 | ボイ ビリス高1 | 札幌山の手高校 | 3:49.16 | +9.96 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 56 | 大門 晃士 | 早大同好会 | 3:49.31 | +10.11 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 56 | 小菅 誠太 | 一関学院 | 3:49.31 | +10.11 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 58 | 後藤琉太 朗 | 中大学連 | 3:49.61 | +10.41 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 58 | 後藤琉太 朗 | 中央大学 | 3:49.61 | +10.41 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 60 | 中島 陸斗高2 | 鹿児島鹿児島城西高 | 3:49.78 | +10.58 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 61 | 杉原 立樹 | 上武大学 | 3:49.83 | +10.63 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 62 | 桒田 旬斗高3 | 倉敷高 | 3:49.87 | +10.67 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 63 | 氷見 練之介高3 | 富山商高 | 3:50.25 | +11.05 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 64 | 森田 瑛仁高2 | 市立松戸高校 | 3:50.30 | +11.10 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 65 | 野川 元希大2 | 明治大学 | 3:50.31 | +11.11 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 65 | 野川 元希 | 明大 | 3:50.31 | +11.11 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 67 | 丸山 展 | 中越 | 3:50.48 | +11.28 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 68 | 俵 匠生高2 | 長崎日本大学高 | 3:50.55 | +11.35 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 69 | 大塚 直哉 | - | 3:50.64 | +11.44 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 70 | 矢野 侑典 | 宮崎小林 | 3:50.69 | +11.49 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 71 | 佐藤 新太 | 山梨学院 | 3:50.78 | +11.58 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 72 | 古賀 想太 | 市立前橋 | 3:50.86 | +11.66 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 73 | 加藤 大地 | 日本体育大学 | 3:50.96 | +11.76 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 73 | 加藤 大地 | 日体大 | 3:50.96 | +11.76 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 75 | 陳内 紫音 | 東洋大 | 3:50.98 | +11.78 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 75 | 陳内 紫音大2 | 東洋大学 | 3:50.98 | +11.78 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 77 | 成沢 翔英大2 | 慶應義塾大学 | 3:51.02 | +11.82 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 77 | 成沢 翔英 | 慶大 | 3:51.02 | +11.82 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 79 | 百田 好希高2 | 鎮西学院高校 | 3:51.05 | +11.85 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 80 | 増子 風希 | 明大 | 3:51.09 | +11.89 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 80 | 増子 風希 | - | 3:51.09 | +11.89 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 82 | 尾池 駿一高2 | 城ノ内中等高 | 3:51.22 | +12.02 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 83 | 青木 龍翔 | 立大学連 | 3:51.46 | +12.26 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 83 | 中村 仁 | 津島東 | 3:51.46 | +12.26 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 85 | 井口 愁斗 | 東国大 | 3:51.64 | +12.44 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 86 | 根ヶ山 蓮 | 埼玉栄 | 3:51.88 | +12.68 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 87 | 熊井 渓人 | 青山学院大学 | 3:52.10 | +12.90 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 87 | 熊井 渓人 | 青学大 | 3:52.10 | +12.90 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 87 | 大野 聖登 | - | 3:52.10 | +12.90 | 第20回トワイライト・ゲームス |
| 90 | 齋藤 瑠来高2 | 北見北斗高校 | 3:52.18 | +12.98 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 91 | 加藤 元晴大3 | 拓殖大学 | 3:52.22 | +13.02 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 91 | 加藤 元晴 | 拓大 | 3:52.22 | +13.02 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 93 | 梅原 悠良 | 東農大 | 3:52.54 | +13.34 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 94 | 仙石 旭大4 | 国士舘大学 | 3:52.72 | +13.52 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 94 | 仙石 旭 | 国士大 | 3:52.72 | +13.52 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 96 | 杉原 立樹 | 上武大学連 | 3:52.79 | +13.59 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 97 | 山本 圭悟 | 米子東 | 3:53.13 | +13.93 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 98 | 立迫 大徳 | - | 3:53.14 | +13.94 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 98 | 立迫 大徳 | 早大 | 3:53.14 | +13.94 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 100 | 川副 剛煌高3 | 鳥栖工高 | 3:53.20 | +14.00 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
