| 1 | 熊本 春来 | 智辯カレッジ高 | 1:51.00 | | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 2 | 吉田 裕心 | 札幌創成高校 | 1:51.89 | +0.89 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 3 | 神谷 幌 | 浜松北高 | 1:52.02 | +1.02 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 4 | 西 祐杜 | 同志社大学 | 1:52.53 | +1.53 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 5 | 東條 颯介 | 智辯カレッジ高 | 1:52.67 | +1.67 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 6 | 堀 翠快 | 岐阜農林高 | 1:52.99 | +1.99 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 7 | 齋藤 瑠来 | 北見北斗高校 | 1:53.05 | +2.05 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 8 | 吉村 龍我 | 太田高 | 1:53.11 | +2.11 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 9 | 小島 汀稀 | 川口市立高 | 1:53.25 | +2.25 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 10 | 大田 蘭斗 | 広島国際学院 | 1:53.27 | +2.27 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
|
| 11 | 我妻 廉椛 | 白石高 | 1:53.28 | +2.28 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 12 | 山田 和生 | 帯広柏葉高 | 1:53.31 | +2.31 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 13 | 大森 友敬 | 七尾 | 1:53.37 | +2.37 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 14 | 地内 爽流 | 鳥栖工業 | 1:53.52 | +2.52 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 15 | 尾池 駿一 | 城ノ内中等高 | 1:53.53 | +2.53 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 16 | 南 陽太 | 九州医療科学大 | 1:53.55 | +2.55 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 16 | 森田 瑛仁 | 市立松戸高校 | 1:53.55 | +2.55 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 18 | 久保 拓未 | 玉野光南高 | 1:53.68 | +2.68 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 19 | 藤川 陽 | 徳島北高 | 1:53.69 | +2.69 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 20 | 竹下 朋希 | 岡山大学 | 1:53.74 | +2.74 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 21 | 三枝 琥珀 | 京都産業大学 | 1:54.13 | +3.13 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 21 | 三好 悠太 | 宇和 | 1:54.13 | +3.13 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 23 | 安達 吏玖 | 高砂 | 1:54.17 | +3.17 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 24 | 清川 修一朗 | 駒大高校 | 1:54.52 | +3.52 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 25 | 酒井 琉成 | 鳳高 | 1:54.59 | +3.59 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 26 | 古川 弘貴 | 世羅 | 1:54.60 | +3.60 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 27 | 栗原 晋作 | 明大八王子高 | 1:54.61 | +3.61 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 28 | 大森 友敬 | 七尾高 | 1:54.76 | +3.76 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 29 | 岡野 竜之介 | 清風高校 | 1:54.82 | +3.82 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 30 | 堀内 盟 | 秋田中央 | 1:54.88 | +3.88 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 31 | 飯田 空良 | 相洋高校 | 1:55.03 | +4.03 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 32 | 伊藤 広翔 | 國學院大学 | 1:55.05 | +4.05 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 33 | 池田 武蔵 | 伊勢学園高 | 1:55.14 | +4.14 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 34 | 福留 和真 | 鹿児島高 | 1:55.34 | +4.34 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 35 | 地内 爽流 | 鳥栖工高 | 1:55.47 | +4.47 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 36 | 本間 太雲 | 坂戸西高校 | 1:55.48 | +4.48 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 37 | 谷 祐大 | 東洋大牛久高校 | 1:55.60 | +4.60 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 38 | 大西 凛空 | 北海高 | 1:55.73 | +4.73 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 39 | 髙塚 琉 | 足立高 | 1:55.75 | +4.75 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 40 | 犬塚 尚吾 | 中京大学 | 1:55.88 | +4.88 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 41 | 安井 靖射 | 大津商高 | 1:56.55 | +5.55 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 42 | 渡邉 勝斗 | 開建高 | 1:56.67 | +5.67 | 第60回京都府高等学校春季陸上競技大会 |
| 43 | 真喜 郁斗 | 岐阜高 | 1:56.73 | +5.73 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 44 | 高倉 悠歳 | 北見柏陽高 | 1:56.87 | +5.87 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 45 | 植田 翔己 | 八王子高校 | 1:57.37 | +6.37 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 46 | 森 幸翔 | 星稜高 | 1:57.47 | +6.47 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 47 | 名合 幸弘 | 玉野光南高 | 1:57.72 | +6.72 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 48 | 中村 亜簾 | 学法石川高校 | 1:57.75 | +6.75 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 49 | 渡邉 陽仁 | 彦根翔西館高 | 1:58.01 | +7.01 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 50 | 松村 光紀 | 桐生工業高校 | 1:58.18 | +7.18 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 51 | 大畑 裕一朗 | 智辯和歌山高 | 1:58.40 | +7.40 | 和歌山県春季陸上競技選手権大会 |
| 52 | 並木 蓮 | 舞岡高 | 1:58.47 | +7.47 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 53 | 髙橋 琉希 | 大津商高 | 1:58.57 | +7.57 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 54 | 西村 悠也 | 水口東高 | 1:59.24 | +8.24 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 55 | 畑 仁智甫 | 膳所高 | 1:59.78 | +8.78 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 56 | 辻野 優太 | 市立柏高校 | 1:59.84 | +8.84 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 57 | 久保 凛 | 東大阪大敬愛高校 | 2:00.28 | +9.28 | 第40回静岡国際陸上 |
| 58 | 竹内 莉晄 | 草津高 | 2:00.59 | +9.59 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 59 | 豊村 宏太 | 明石清水高 | 2:00.62 | +9.62 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 60 | 田伏 瑞基 | 智辯和歌山高 | 2:01.07 | +10.07 | 和歌山県春季陸上競技選手権大会 |
| 61 | 嘉藤 颯大 | 北見北斗高校 | 2:01.31 | +10.31 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 62 | 茂木 琳 | 城西大城西高校 | 2:01.39 | +10.39 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 63 | 高橋 哲平 | 西京高 | 2:02.67 | +11.67 | 第60回京都府高等学校春季陸上競技大会 |
| 64 | 福永 怜央 | 長浜北高 | 2:02.79 | +11.79 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 65 | 水野 遥翔 | 甲西高 | 2:02.95 | +11.95 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 66 | 吉本 光汰 | 幸福関西高 | 2:03.70 | +12.70 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 67 | 北村 優太 | 洛北 | 2:03.77 | +12.77 | 第60回京都府高等学校春季陸上競技大会 |
| 68 | 高橋 歩蓮 | 石巻高 | 2:04.62 | +13.62 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 69 | 小松 美咲 | 中村学園女子高 | 2:05.09 | +14.09 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 70 | 福本 瑛士 | 彦根東高 | 2:05.15 | +14.15 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 71 | 岡野 太智 | 膳所高 | 2:05.28 | +14.28 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 72 | 田中 孝太郎 | 八幡工高 | 2:05.49 | +14.49 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 73 | 今枝 瞳 | 中京大中京 | 2:05.73 | +14.73 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 74 | 田村 実彩 | 東大阪大敬愛高校 | 2:05.96 | +14.96 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 75 | 重永 瑛太 | 東大津高 | 2:06.13 | +15.13 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 76 | 近藤 愛翔 | 和歌山工高 | 2:06.28 | +15.28 | 和歌山県春季陸上競技選手権大会 |
| 77 | 今枝 瞳 | 中京大中京高校 | 2:06.66 | +15.66 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 78 | 奥田 涼太郎 | 八日市高 | 2:06.74 | +15.74 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 79 | 白井 佑季 | 光泉カトリック高 | 2:07.04 | +16.04 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 80 | 殿水 雄登 | 田辺 | 2:07.87 | +16.87 | 和歌山県春季陸上競技選手権大会 |
| 81 | 葛川 宗佑 | 長浜北高 | 2:08.11 | +17.11 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 82 | 長島 彩音 | 宇都宮文星女 | 2:08.43 | +17.43 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 83 | 荒木 睦桔 | 水口東高 | 2:08.53 | +17.53 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 84 | 中北 洸太 | 八幡工高 | 2:08.57 | +17.57 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 85 | 小林 由依 | 東大阪大敬愛高校 | 2:08.69 | +17.69 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 86 | 岡田 隆之介 | 水口東高 | 2:09.77 | +18.77 | 2025 SUMMER GAMES in HIKONE |
| 87 | 尾引 悠歩 | 川和 | 2:10.85 | +19.85 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 88 | 松下 千紗 | 仙台育英高校 | 2:10.86 | +19.86 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 89 | 大崎 紗楽 | 富士市立高 | 2:10.99 | +19.99 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 90 | 牛谷 和士 | 虎姫高 | 2:11.00 | +20.00 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 90 | 松浦 銘玉 | 埼玉栄 | 2:11.00 | +20.00 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 92 | 東 はる | 須磨学園高校 | 2:11.22 | +20.22 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 93 | 滝本 茉心 | 盛岡三高 | 2:11.23 | +20.23 | 第79回国民スポーツ大会 |
| 94 | 光岡 翼 | 八幡商高 | 2:11.28 | +20.28 | 第1回滋賀陸上競技協会記録会 |
| 95 | 江藤 杏奈 | 中京大中京 | 2:11.45 | +20.45 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 96 | 根本 心海 | 東大附中等 | 2:11.53 | +20.53 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 97 | 松山 桜彩 | 星稜高 | 2:11.57 | +20.57 | 第78回全国高等学校総合体育大会陸上競技大会2025 |
| 98 | 石川 智尋 | 山手学院高校 | 2:11.58 | +20.58 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |
| 99 | 尾関 里帆 | 聖マリア高 | 2:11.76 | +20.76 | 第19回U18・第56回U16陸上競技大会 |
| 100 | 山岡 陽依 | 昌平高校 | 2:11.92 | +20.92 | 第41回U20日本陸上競技選手権大会 |