| 1 | 佐藤 圭汰 | - | 13:16.29 | | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 2 | ダパッシュ ラファエル | JR東日本 | 13:19.98 | +3.69 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 3 | ケルビン キプラガット | 愛三工業 | 13:24.64 | +8.35 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 4 | ダンカン マイナ | 専修大学 | 13:34.16 | +17.87 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 5 | ブライアン キピエゴ | - | 13:34.27 | +17.98 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 6 | デニス キプルト | 日本薬大学 | 13:35.50 | +19.21 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 7 | ジョセフ ムイガイ | 平成国際大学 | 13:36.75 | +20.46 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 8 | マンガッタ キベト | マツダ | 13:37.21 | +20.92 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 9 | ネルソン マンデランビティ | 桜美林大学 | 13:39.12 | +22.83 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 10 | 小池 莉希 | 創価大学 | 13:39.14 | +22.85 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
|
| 11 | 吉岡 大翔 | 順天堂大学 | 13:41.20 | +24.91 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 12 | 小山 翔也 | 駒澤大学 | 13:41.99 | +25.70 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 13 | 川﨑 颯 | 筑波大学 | 13:42.99 | +26.70 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 14 | ラファエル ロンギサ | 拓殖大学 | 13:43.99 | +27.70 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 15 | スティーブン レマイヤン | 駿河台大学 | 13:44.67 | +28.38 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 16 | 永本 脩 | 東海大学 | 13:52.61 | +36.32 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 17 | 野中 恒亨 | 國學院大学 | 13:52.93 | +36.64 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 18 | 大野 聖登 | 順天堂大学 | 13:54.42 | +38.13 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 19 | 伊藤 春輝 | 中央大学 | 13:55.29 | +39.00 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 20 | ムアシア ジャスタス | 富士山GX | 13:55.84 | +39.55 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 21 | 工藤 信太朗 | 駒澤大学 | 13:56.28 | +39.99 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 22 | 谷村 恒晟 | 関西大学 | 13:57.02 | +40.73 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 23 | 宮本 凪 | 城西大学 | 13:57.04 | +40.75 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 24 | 浜川 舜斗 | 青山学院大学 | 13:58.72 | +42.43 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 25 | 塩原 匠 | 順天堂大学 | 14:00.00 | +43.71 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 26 | 青木 龍翔 | 立教大学 | 14:00.24 | +43.95 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 27 | 後村 光星 | 國學院大学 | 14:02.08 | +45.79 | 関東学生網走夏季記録挑戦競技会 |
| 28 | 田中 純 | 東洋大学 | 14:02.41 | +46.12 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 29 | 大和田 貴治 | 駒澤大学 | 14:03.49 | +47.20 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 30 | 瀬間 元輔 | 早稲田大学 | 14:04.97 | +48.68 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 31 | 中野 純平 | 東海大学 | 14:05.12 | +48.83 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 32 | ジュレミア カマウ | 立正大学 | 14:05.41 | +49.12 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 33 | 谷口 颯太 | 帝京大学 | 14:05.77 | +49.48 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 34 | 石井 啓太 | 順天堂大学 | 14:07.52 | +51.23 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 35 | 山本 琉楓 | 神奈川大学 | 14:08.43 | +52.14 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 36 | 柴田 侑 | 城西大学 | 14:08.64 | +52.35 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 37 | 鳥井 健太 | 青山学院大学 | 14:08.86 | +52.57 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 38 | 中村 光樹 | 武蔵野学院大学 | 14:08.95 | +52.66 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 39 | 植阪 嶺児 | 駒澤大学 | 14:09.38 | +53.09 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 40 | 鈴木 健真 | 城西大学 | 14:10.35 | +54.06 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 41 | 中村 海斗 | 青山学院大学 | 14:11.51 | +55.22 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 42 | 河野 世寿 | 城西大学 | 14:11.77 | +55.48 | 関東学生網走夏季記録挑戦競技会 |
| 43 | 江上 天晴 | 国士舘大学 | 14:11.99 | +55.70 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 44 | 戸田 夏輝 | NDソフト | 14:12.03 | +55.74 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 45 | 井坂 佳亮 | 明治大学 | 14:12.57 | +56.28 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 46 | 宮倉 騎士 | 大東文化大学 | 14:12.99 | +56.70 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 47 | 前野 皓士 | 皇學館大学 | 14:13.14 | +56.85 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 48 | 武田 知典 | 早稲田大学 | 14:13.39 | +57.10 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 49 | 小田 伊織 | 城西大学 | 14:13.86 | +57.57 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 50 | 小川 晴也 | 広島経済大学 | 14:14.31 | +58.02 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 51 | 植田 航生 | 芝浦工業大学 | 14:14.73 | +58.44 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 52 | 栗本 航希 | 東京農業大学 | 14:14.95 | +58.66 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 53 | 楠岡 由浩 | 帝京大学 | 14:15.20 | +58.91 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 54 | 藤田 大輝 | 京都産業大学 | 14:16.59 | +1:00.30 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 55 | 中嶋 希 | 岐阜協立大学 | 14:17.15 | +1:00.86 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 56 | 矢部 慎之介 | 東海大学 | 14:18.42 | +1:02.13 | 日体大女子長距離競技会 |
| 57 | 伊藤 光輝 | 桜美林大学 | 14:18.74 | +1:02.45 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 58 | 村木 風舞 | 城西大学 | 14:18.85 | +1:02.56 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 59 | 吉田 奏斗 | 東北学院大学 | 14:19.96 | +1:03.67 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 60 | 塩原 匠 | 富士山GX | 14:20.87 | +1:04.58 | 関東学生網走夏季記録挑戦競技会 |
| 61 | 丹野 暁翔 | 芝浦工業大学 | 14:21.28 | +1:04.99 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 62 | 藤井 達希 | 駿河台大学 | 14:21.55 | +1:05.26 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 63 | 下中野 篤将 | 駿河台大学 | 14:21.60 | +1:05.31 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 64 | 後藤 琉太朗 | 中央大学 | 14:22.07 | +1:05.78 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 65 | 栗田 紳冴 | 札幌学院大学 | 14:22.37 | +1:06.08 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 66 | 木下 瑛仁 | 駿河台大学 | 14:22.44 | +1:06.15 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 67 | 大森 智 | 東京大学 | 14:22.73 | +1:06.44 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 68 | 南部 悠陽 | 同志社大学 | 14:23.22 | +1:06.93 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 69 | 児島 雄一郎 | 順天堂大学 | 14:23.37 | +1:07.08 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 70 | 安田 陸人 | 慶應義塾大学 | 14:23.69 | +1:07.40 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 71 | 光安 航希 | 亜細亜大学 | 14:24.13 | +1:07.84 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 72 | 稲見 峻 | 中央学院大学 | 14:24.75 | +1:08.46 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 73 | 上山 詩樹 | 専修大学 | 14:24.88 | +1:08.59 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 74 | 和田 麻里 | 大東文化大学 | 14:25.17 | +1:08.88 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 75 | 藤田 剛史 | 摂南大学 | 14:25.53 | +1:09.24 | エディオンディスタンスチャレンジin大阪2025 |
| 76 | 加藤 元晴 | 拓殖大学 | 14:25.65 | +1:09.36 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 77 | 名和 純希 | 流通経済大学 | 14:25.82 | +1:09.53 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 78 | 古橋 希翁 | 駿河台大学 | 14:26.59 | +1:10.30 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 79 | 稲木 祐人 | 上武大学 | 14:26.62 | +1:10.33 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 80 | 片桐 貫太 | MORE | 14:27.19 | +1:10.90 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 81 | 戸田 颯人 | 長崎国際大学 | 14:27.45 | +1:11.16 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 82 | 浜田 翔太 | 駿河台大学 | 14:28.05 | +1:11.76 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 83 | 國安 一翔 | 帝京大学 | 14:28.44 | +1:12.15 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 84 | 兵藤 颯太 | 鹿屋体育大学 | 14:28.47 | +1:12.18 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 85 | 上田 康平 | 大阪経済大学 | 14:28.87 | +1:12.58 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 86 | 添田 竜馬 | 平成国際大学 | 14:29.94 | +1:13.65 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 87 | 橋本 友樹 | 大阪経済大学 | 14:30.32 | +1:14.03 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 88 | 大岩 蓮 | 神奈川大学 | 14:30.46 | +1:14.17 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 89 | 野見山 観人 | 中央学院大学 | 14:30.57 | +1:14.28 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 90 | 小松 優輝 | 順天堂大学 | 14:30.84 | +1:14.55 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 91 | キム テフン | 韓国実業団連盟 | 14:31.05 | +1:14.76 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 92 | 日比野 陸 | 専修大学 | 14:31.76 | +1:15.47 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 93 | 三井 悠暉 | 明治大学陸上競技同好会 | 14:32.68 | +1:16.39 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 94 | 服部 哩旺 | 東海大学 | 14:32.70 | +1:16.41 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 95 | 芳口 慧人 | 流通経済大学 | 14:33.07 | +1:16.78 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 96 | 新間 圭 | 皇學館大学 | 14:33.46 | +1:17.17 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 97 | 藤井 智己 | 東海大学 | 14:34.76 | +1:18.47 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 98 | 清水 喜一郎 | 第一工科大学 | 14:35.49 | +1:19.20 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 98 | 小野寺 颯太 | 大東文化大学 | 14:35.49 | +1:19.20 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 100 | 鬼塚 大翔 | 明治大学 | 14:35.59 | +1:19.30 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |