| 1 | シャドラック キップケメイ | - | 13:16.29 | | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 2 | ANTHONY MAINA | トヨタ自動車九 | 13:20.75 | +4.46 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 3 | 伊藤 大志 | NTT西日本 | 13:25.65 | +9.36 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 4 | ラファエル ロンギサ | 拓殖大学 | 13:25.99 | +9.70 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 5 | 吉居 駿恭 | - | 13:26.31 | +10.02 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 6 | キベット ロジャース | コニカミノルタ | 13:26.55 | +10.26 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 7 | コリル フェリックス | トヨタ自動車 | 13:29.58 | +13.29 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 8 | ヴィクター キプキルイ | 中電工 | 13:33.46 | +17.17 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 9 | ジェームス ムトゥク | 山梨学院大学 | 13:34.88 | +18.59 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 10 | 溜池 一太 | - | 13:35.33 | +19.04 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
|
| 11 | 溜池 一太 | 中央大学 | 13:36.93 | +20.64 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 12 | チェプセルゴン リチャード | サンベルクス | 13:37.52 | +21.23 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 13 | 花岡 寿哉 | 東海大学 | 13:42.49 | +26.20 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 14 | 大島 史也 | 法政大学 | 13:44.43 | +28.14 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 15 | 平島 龍斗 | 日本体育大学 | 13:46.30 | +30.01 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 16 | 田島 駿介 | 日本体育大学 | 13:50.50 | +34.21 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 17 | 山中 達貴 | 城西大学 | 13:51.58 | +35.29 | 第33回金栗記念選抜陸上中長距離熊本大会2025 |
| 18 | 横尾 皓 | 芝浦工業大学 | 13:53.35 | +37.06 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 19 | 兵藤 ジュダ | 東海大学 | 13:54.41 | +38.12 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 20 | 鈴木 天智 | 東海大学 | 13:55.91 | +39.62 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 21 | 西塚 璃純 | 札幌学院大学 | 13:56.83 | +40.54 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 22 | 森下 翔太 | 明治大学 | 13:56.94 | +40.65 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 23 | 神田 大地 | 青山学院大学 | 13:57.24 | +40.95 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 24 | 深堀 優 | 東京農業大学 | 13:57.47 | +41.18 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 25 | 新井 友裕 | 専修大学 | 13:58.04 | +41.75 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 26 | 小山 洋生 | 筑波大学 | 13:58.59 | +42.30 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 27 | 竹割 真 | 東海大学 | 13:59.36 | +43.07 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 28 | 秋吉 拓真 | 東京大学 | 13:59.92 | +43.63 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 29 | 山﨑 颯 | 順天堂大学 | 13:59.98 | +43.69 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 30 | 堀 颯介 | 明治大学 | 14:02.02 | +45.73 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 31 | カマウ パトリック | 上武大学 | 14:02.29 | +46.00 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 32 | 小田 恭平 | NTT西日本 | 14:03.84 | +47.55 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 33 | 山崎 丞 | 日本体育大学 | 14:04.91 | +48.62 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 34 | 牛ノ濱 翔汰 | JFEスチール | 14:06.68 | +50.39 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 35 | 長谷川 瑠 | プレス工業 | 14:07.24 | +50.95 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 36 | 小島 岳斗 | 東京農業大学 | 14:07.68 | +51.39 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 37 | 山口 智規 | SGH | 14:09.40 | +53.11 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 38 | 金谷 紘大 | 埼玉医科大学G | 14:09.58 | +53.29 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 39 | 西代 雄豪 | NTN | 14:09.69 | +53.40 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 40 | 髙嶋 荘太 | 環太平洋大学 | 14:09.71 | +53.42 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 41 | 古井 康介 | 明治大学 | 14:09.93 | +53.64 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 42 | 吉川 響 | 明治大学 | 14:10.46 | +54.17 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 43 | 坂本 滉斗 | 駿河台大学 | 14:10.47 | +54.18 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 44 | 山本 涼介 | 環太平洋大学 | 14:11.37 | +55.08 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 45 | 久保出 雄太 | 中国電力 | 14:14.02 | +57.73 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 46 | 岡﨑 樹 | 駿河台大学 | 14:14.58 | +58.29 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 47 | 長田 拓己 | 駿河台大学 | 14:15.16 | +58.87 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 48 | 木村 楓斗 | 流通経済大学 | 14:15.35 | +59.06 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 48 | 吉中 祐太 | 中央大学 | 14:15.35 | +59.06 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 50 | 藤井 空大 | 駿河台大学 | 14:15.46 | +59.17 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 51 | 入江 聖空 | びわこ学院大学 | 14:16.76 | +1:00.47 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 52 | 添田 大葵 | 千葉大学 | 14:16.78 | +1:00.49 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 53 | 石堂 留偉 | 育英大学 | 14:16.98 | +1:00.69 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 54 | 太田 翔空 | いわき陸協 | 14:17.40 | +1:01.11 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 55 | 柴戸 遼太 | 帝京大学 | 14:17.53 | +1:01.24 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 56 | 岩田 和大 | 東京科学大学 | 14:17.65 | +1:01.36 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 57 | 山﨑 皓太 | 住友電工 | 14:17.83 | +1:01.54 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 58 | 山本 樹 | 明治大学 | 14:17.89 | +1:01.60 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 59 | 東 秀太 | 広島経済大学 | 14:18.20 | +1:01.91 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 60 | 中島 巨翔 | 城西大学 | 14:18.53 | +1:02.24 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 61 | 木島 陸 | 立教大学 | 14:18.66 | +1:02.37 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 62 | 中戸 元貴 | 新潟大学 | 14:19.50 | +1:03.21 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 63 | 柴田 大輝 | 富士山GX | 14:19.79 | +1:03.50 | 2025ホクレン・ディスタンスチャレンジin北海道 第4戦 北見大会 |
| 64 | 内山 壽頼 | 芝浦工業大学 | 14:19.83 | +1:03.54 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 65 | 本村 翔太 | 東海大学 | 14:20.12 | +1:03.83 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 66 | 平八重充 希 | 山梨学院大学 | 14:20.87 | +1:04.58 | 関東学生網走夏季記録挑戦競技会 |
| 67 | 笠原 雅敬 | 育英大学 | 14:20.88 | +1:04.59 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 68 | 荒原 駿 | 麗澤大学 | 14:23.13 | +1:06.84 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 69 | 二村昇太 朗 | 日本体育大学 | 14:23.48 | +1:07.19 | 第104回関東学生陸上競技対校選手権大会 |
| 70 | 山口 大貴 | 鹿屋体育大学 | 14:23.63 | +1:07.34 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 71 | 松浦 海瑠 | 筑波大学 | 14:23.78 | +1:07.49 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 72 | 山下 利玖 | 帝京大学 | 14:24.19 | +1:07.90 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 73 | 南 凱士 | 広島大学 | 14:24.81 | +1:08.52 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 74 | 山田 陽翔 | 札幌学院大学 | 14:25.24 | +1:08.95 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 75 | 山崎 兼吾 | 東海大学 | 14:25.96 | +1:09.67 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 76 | 西村 悠誠 | 大東文化大学 | 14:26.63 | +1:10.34 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 77 | 粟井 駿平 | マツダ | 14:27.36 | +1:11.07 | 第59回織田幹雄記念国際 |
| 78 | 松本 雄大 | 大東文化大学 | 14:27.90 | +1:11.61 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 79 | 茂木 悠飛 | 山梨学院大学 | 14:27.97 | +1:11.68 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 80 | 早川 拓海 | 札幌学院大学 | 14:29.13 | +1:12.84 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 81 | 八鍬 拓斗 | 山梨学院大学 | 14:29.75 | +1:13.46 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 82 | 千葉 唯登 | 育英大学 | 14:30.07 | +1:13.78 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 83 | 有川 紘樹 | 一橋大学 | 14:30.25 | +1:13.96 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 84 | 伊藤 聡平 | 流通経済大学 | 14:30.36 | +1:14.07 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 85 | 黒葛野 瑞希 | 中央学院大学 | 14:30.40 | +1:14.11 | 第323回日本体育大学長距離競技会 兼 第17回NCG |
| 86 | 藁科 健斗 | 専修大学 | 14:30.48 | +1:14.19 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 87 | 福田 達也 | 専修大学 | 14:32.71 | +1:16.42 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 88 | 福世 翔哉 | 東京経済大学 | 14:33.17 | +1:16.88 | 第321回日本体育大学長距離競技会 兼 第15回NCG |
| 89 | 二瓶 知哉 | 拓殖大学 | 14:33.48 | +1:17.19 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 90 | 馬場 大翔 | 東洋大学 | 14:35.01 | +1:18.72 | 第322回日本体育大学長距離競技会 |
| 91 | 奈良 慧弥 | 武蔵野学院大学 | 14:35.20 | +1:18.91 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 92 | 吉永 歩 | 上武大学 | 14:35.56 | +1:19.27 | 第320回日本体育大学長距離競技会 兼 第14回NCG |
| 93 | 本名 萩 | 山梨学院大学 | 14:36.33 | +1:20.04 | 第325回日本体育大学長距離競技会 兼 第19回NCG |
| 94 | 杉森 星彦 | 慶應義塾大学 | 14:36.53 | +1:20.24 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 95 | 松本 悠真 | 日本体育大学 | 14:38.12 | +1:21.83 | 日体大女子長距離競技会 |
| 96 | 髙橋 重陽 | 平成国際大学 | 14:40.96 | +1:24.67 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 97 | 岩井 響生 | 皇學館大学 | 14:42.64 | +1:26.35 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 98 | 中村 凌也 | 第一工科大学 | 14:42.65 | +1:26.36 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 99 | 村上 隼梧 | 桜美林大学 | 14:43.05 | +1:26.76 | 第324回日本体育大学長距離競技会 兼 第18回NCG |
| 100 | 大下 翼 | 日本体育大学 | 14:43.55 | +1:27.26 | 日体大女子長距離競技会 |